微生物学杂志
微生物學雜誌
미생물학잡지
JOURNAL OF MICROBIOLOGY
2014年
1期
72-77
,共6页
郭玉梅%周吉坤%张慧贤%秦丽云%赵冬%剧慧栋
郭玉梅%週吉坤%張慧賢%秦麗雲%趙鼕%劇慧棟
곽옥매%주길곤%장혜현%진려운%조동%극혜동
嗜肺军团菌%分子分型%SBT%PFGE%AFLP
嗜肺軍糰菌%分子分型%SBT%PFGE%AFLP
기폐군단균%분자분형%SBT%PFGE%AFLP
Legionella pneumophila%molecular typing%sequence based typing (SBT)%pulsed field gel electrophoresis (PFGE)%amplified fragment length polymorphism (AFLP)
比较SBT、PFGE、AFLP三种分子分型方法在嗜肺军团菌分型研究中的分辨力,探讨SBT方法在嗜肺军团菌分型中的可应用性.收集石家庄市6所医院冷却塔水中分离的32株嗜肺军团菌,对其中的24株血清Ⅰ型嗜肺军团菌进行SBT分型研究,并与PFGE和AFLP分型结果进行了比较.24株LP1型嗜肺军团菌共分为4个ST型,分辨系数为0.239 1.PFGE方法将32株菌株共分为15个PFGE型,分辨系数为0.925 4.AFLP方法将32株菌株分为23个AFLP型,分辨系数为0.973 7.通过比对EWGLI网站SBT数据库,ST1021型和ST345型为本地区独特型别且属于同一克隆系;ST1型为优势型别并在我国长期流行;由于缺失neuA而未分型的嗜肺军团菌株与其他23株菌分属于不同的克隆系.SBT方法的分型能力不及PFGE方法和AFLP方法.但SBT分型方法能够通过全球比对数据库得到更多的关于菌株遗传进化和流行分布的资料,在研究菌株分子流行病学及进化方面优于PFGE和AFLP方法.
比較SBT、PFGE、AFLP三種分子分型方法在嗜肺軍糰菌分型研究中的分辨力,探討SBT方法在嗜肺軍糰菌分型中的可應用性.收集石傢莊市6所醫院冷卻塔水中分離的32株嗜肺軍糰菌,對其中的24株血清Ⅰ型嗜肺軍糰菌進行SBT分型研究,併與PFGE和AFLP分型結果進行瞭比較.24株LP1型嗜肺軍糰菌共分為4箇ST型,分辨繫數為0.239 1.PFGE方法將32株菌株共分為15箇PFGE型,分辨繫數為0.925 4.AFLP方法將32株菌株分為23箇AFLP型,分辨繫數為0.973 7.通過比對EWGLI網站SBT數據庫,ST1021型和ST345型為本地區獨特型彆且屬于同一剋隆繫;ST1型為優勢型彆併在我國長期流行;由于缺失neuA而未分型的嗜肺軍糰菌株與其他23株菌分屬于不同的剋隆繫.SBT方法的分型能力不及PFGE方法和AFLP方法.但SBT分型方法能夠通過全毬比對數據庫得到更多的關于菌株遺傳進化和流行分佈的資料,在研究菌株分子流行病學及進化方麵優于PFGE和AFLP方法.
비교SBT、PFGE、AFLP삼충분자분형방법재기폐군단균분형연구중적분변력,탐토SBT방법재기폐군단균분형중적가응용성.수집석가장시6소의원냉각탑수중분리적32주기폐군단균,대기중적24주혈청Ⅰ형기폐군단균진행SBT분형연구,병여PFGE화AFLP분형결과진행료비교.24주LP1형기폐군단균공분위4개ST형,분변계수위0.239 1.PFGE방법장32주균주공분위15개PFGE형,분변계수위0.925 4.AFLP방법장32주균주분위23개AFLP형,분변계수위0.973 7.통과비대EWGLI망참SBT수거고,ST1021형화ST345형위본지구독특형별차속우동일극륭계;ST1형위우세형별병재아국장기류행;유우결실neuA이미분형적기폐군단균주여기타23주균분속우불동적극륭계.SBT방법적분형능력불급PFGE방법화AFLP방법.단SBT분형방법능구통과전구비대수거고득도경다적관우균주유전진화화류행분포적자료,재연구균주분자류행병학급진화방면우우PFGE화AFLP방법.
