现代检验医学杂志
現代檢驗醫學雜誌
현대검험의학잡지
JOURNAL OF MODERN LABORATORY MEDICINE
2014年
2期
34-37
,共4页
徐向红%郭天康%苏海翔%魏丽%李永红%徐辉
徐嚮紅%郭天康%囌海翔%魏麗%李永紅%徐輝
서향홍%곽천강%소해상%위려%리영홍%서휘
MAPT基因%SNPs等位基因%多态性%基因频率%阿尔茨海默病%HapMap
MAPT基因%SNPs等位基因%多態性%基因頻率%阿爾茨海默病%HapMap
MAPT기인%SNPs등위기인%다태성%기인빈솔%아이자해묵병%HapMap
MAPT gene%SNPs allele%polymorphism%genes frequency%Alzheimer's disease%HapMap
目的 用生物信息学方法挑选中国汉族人群中的MAPT基因标签单核苷酸多态性(tag-SNPs)位点,考察中国汉族人群MAPT基因与老年痴呆症的关系.方法 通过Hapmap数据库获取中国汉族人群的MAPT基因SNPs数据;应用Haploview4.2对MAPT基因进行连锁不平衡分析;在D'值95％可信区间内构建单体域;根据单体域内SNPs之间的r2值和LOD值,挑选标签SNP.结果 MAPT基因70个SNPs中,15个(21.43％) SNPs为纯合基因型,MAF高于10％的SNPs为44个,占62.86％.利用55个合格SNPs确定了26个标签SNPs,构建了8个单体域,各单体域以其前两种单体型为主,累计频率在61.9％～100.0％之间.结论 中国汉族人群MAPT基因的26个SNPs位点是较具代表性的标志性位点,可被选为标签SNPs,并作为中国汉族人群MAPT基因与老年痴呆症的关联研究.
目的 用生物信息學方法挑選中國漢族人群中的MAPT基因標籤單覈苷痠多態性(tag-SNPs)位點,攷察中國漢族人群MAPT基因與老年癡呆癥的關繫.方法 通過Hapmap數據庫穫取中國漢族人群的MAPT基因SNPs數據;應用Haploview4.2對MAPT基因進行連鎖不平衡分析;在D'值95％可信區間內構建單體域;根據單體域內SNPs之間的r2值和LOD值,挑選標籤SNP.結果 MAPT基因70箇SNPs中,15箇(21.43％) SNPs為純閤基因型,MAF高于10％的SNPs為44箇,佔62.86％.利用55箇閤格SNPs確定瞭26箇標籤SNPs,構建瞭8箇單體域,各單體域以其前兩種單體型為主,纍計頻率在61.9％～100.0％之間.結論 中國漢族人群MAPT基因的26箇SNPs位點是較具代錶性的標誌性位點,可被選為標籤SNPs,併作為中國漢族人群MAPT基因與老年癡呆癥的關聯研究.
목적 용생물신식학방법도선중국한족인군중적MAPT기인표첨단핵감산다태성(tag-SNPs)위점,고찰중국한족인군MAPT기인여노년치태증적관계.방법 통과Hapmap수거고획취중국한족인군적MAPT기인SNPs수거;응용Haploview4.2대MAPT기인진행련쇄불평형분석;재D'치95％가신구간내구건단체역;근거단체역내SNPs지간적r2치화LOD치,도선표첨SNP.결과 MAPT기인70개SNPs중,15개(21.43％) SNPs위순합기인형,MAF고우10％적SNPs위44개,점62.86％.이용55개합격SNPs학정료26개표첨SNPs,구건료8개단체역,각단체역이기전량충단체형위주,루계빈솔재61.9％～100.0％지간.결론 중국한족인군MAPT기인적26개SNPs위점시교구대표성적표지성위점,가피선위표첨SNPs,병작위중국한족인군MAPT기인여노년치태증적관련연구.
