现代检验医学杂志
現代檢驗醫學雜誌
현대검험의학잡지
JOURNAL OF MODERN LABORATORY MEDICINE
2014年
2期
13-17
,共5页
舒颖%魏新素%童永清%张平安
舒穎%魏新素%童永清%張平安
서영%위신소%동영청%장평안
等位基因特异性PCR%Toll样受体9基因%单核苷酸多态性
等位基因特異性PCR%Toll樣受體9基因%單覈苷痠多態性
등위기인특이성PCR%Toll양수체9기인%단핵감산다태성
allele specific PCR%toll like receptor 9 gene%single nucleotide polymorphism
目的 建立一种快速检测Toll样受体9(toll-like receptor 9,TLR9)基因rs187084和rs352140单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)的方法,以及应用该方法检测湖北地区汉族人群各基因型的分布情况.方法 根据TLR9基因rs187084和rs352140 SNP中碱基变异频率分别设计野生型、突变型以及内参引物,建立等位基因特异性聚合酶链反应(allele specific PCR,AS PCR)检测135例体检人群外周血基因组DNA,以DNA测序法检测结果作为参照标准,并统计分析不同基因型在人群中的分布.结果 135例样本SNP位点均出现相应的野生型、突变型或者杂合子个体,AS-PCR的检测结果与DNA测序符合率为100%.湖北地区体检人群TILR9基因rs187084位点基因型为:CC型占8.14%(11/135),TT型占41.48%(56/135),CT型占50.37%(68/135).CC型所占比例最小(x2=82.21,P<0.05),CT型比例略高于TT型,差异无统计学意义(x2=2.15,P>0.05).TLR9基因rs352140位点基因型为:CC型占41.48%(56/135),TT型占11.11%(15/135),CT型占47.41%(64/135). TT基因型所占比例最小(x2=46.07,P<0.05),CT型略高于CC型,差异无统计学意义(x2 =0.96,P>0.05).结论 AS-PCR是一种简单、快速、可靠以及低成本检测TLR9基因SNP的方法.
目的 建立一種快速檢測Toll樣受體9(toll-like receptor 9,TLR9)基因rs187084和rs352140單覈苷痠多態性(single nucleotide polymorphism,SNP)的方法,以及應用該方法檢測湖北地區漢族人群各基因型的分佈情況.方法 根據TLR9基因rs187084和rs352140 SNP中堿基變異頻率分彆設計野生型、突變型以及內參引物,建立等位基因特異性聚閤酶鏈反應(allele specific PCR,AS PCR)檢測135例體檢人群外週血基因組DNA,以DNA測序法檢測結果作為參照標準,併統計分析不同基因型在人群中的分佈.結果 135例樣本SNP位點均齣現相應的野生型、突變型或者雜閤子箇體,AS-PCR的檢測結果與DNA測序符閤率為100%.湖北地區體檢人群TILR9基因rs187084位點基因型為:CC型佔8.14%(11/135),TT型佔41.48%(56/135),CT型佔50.37%(68/135).CC型所佔比例最小(x2=82.21,P<0.05),CT型比例略高于TT型,差異無統計學意義(x2=2.15,P>0.05).TLR9基因rs352140位點基因型為:CC型佔41.48%(56/135),TT型佔11.11%(15/135),CT型佔47.41%(64/135). TT基因型所佔比例最小(x2=46.07,P<0.05),CT型略高于CC型,差異無統計學意義(x2 =0.96,P>0.05).結論 AS-PCR是一種簡單、快速、可靠以及低成本檢測TLR9基因SNP的方法.
목적 건립일충쾌속검측Toll양수체9(toll-like receptor 9,TLR9)기인rs187084화rs352140단핵감산다태성(single nucleotide polymorphism,SNP)적방법,이급응용해방법검측호북지구한족인군각기인형적분포정황.방법 근거TLR9기인rs187084화rs352140 SNP중감기변이빈솔분별설계야생형、돌변형이급내삼인물,건립등위기인특이성취합매련반응(allele specific PCR,AS PCR)검측135례체검인군외주혈기인조DNA,이DNA측서법검측결과작위삼조표준,병통계분석불동기인형재인군중적분포.결과 135례양본SNP위점균출현상응적야생형、돌변형혹자잡합자개체,AS-PCR적검측결과여DNA측서부합솔위100%.호북지구체검인군TILR9기인rs187084위점기인형위:CC형점8.14%(11/135),TT형점41.48%(56/135),CT형점50.37%(68/135).CC형소점비례최소(x2=82.21,P<0.05),CT형비례략고우TT형,차이무통계학의의(x2=2.15,P>0.05).TLR9기인rs352140위점기인형위:CC형점41.48%(56/135),TT형점11.11%(15/135),CT형점47.41%(64/135). TT기인형소점비례최소(x2=46.07,P<0.05),CT형략고우CC형,차이무통계학의의(x2 =0.96,P>0.05).결론 AS-PCR시일충간단、쾌속、가고이급저성본검측TLR9기인SNP적방법.