中国防痨杂志
中國防癆雜誌
중국방로잡지
BULLETIN OF THE CHINESE ANTITUBERCULOSIS ASSOCIATION
2014年
6期
434-439
,共6页
汪文斐%张国良%杨帆%杨辉%赵丽芳%徐发圣%张明霞%陈心春
汪文斐%張國良%楊帆%楊輝%趙麗芳%徐髮聖%張明霞%陳心春
왕문비%장국량%양범%양휘%조려방%서발골%장명하%진심춘
结核,肺%多态性,单核苷酸%白细胞介素类%光谱法,质量,基质辅助激光解吸电离%DNA探针%疾病遗传易感性
結覈,肺%多態性,單覈苷痠%白細胞介素類%光譜法,質量,基質輔助激光解吸電離%DNA探針%疾病遺傳易感性
결핵,폐%다태성,단핵감산%백세포개소류%광보법,질량,기질보조격광해흡전리%DNA탐침%질병유전역감성
Tuberculosis,pulmonary%Polymorphism,single nucleotide%Interleukins%Spectrometry,mass,matrix-assisted laser desorption-ionization%DNA probes%Genetic predisposition to disease
目的 对比分析飞行时间质谱技术(MALDI-TOF)和TaqMan探针筛选与结核病易感性相关单核苷酸多态性(SNP)位点的结果,以及联合应用的方法学和效果评价.方法 选取2010年10月至2011年4月在深圳市第三人民医院收治并确诊的结核病患者400例为结核病组,对照组为同时期收集的健康体检者300名,利用MALDI-TOF对选取的7个SNP位点(rs2227476、rs1800795、rs56077270、rs1800797、rs2227484、rs2227472和rs2227473)同时进行基因分型,初步筛选易感SNP位点;与结核病易感相关的单个SNP位点,采用基于TaqMan探针技术的实时荧光定量PCR对同样的标本再进行基因分型,比较两种方法的准确性与敏感度;以rs2227473位点为实例对分型结果的基因频率进行分析,确定肺结核的易感SNP.结果 MALDI-TOF分型成功率为99.7％(698/700),TaqMan探针技术为98.4％(689/700);在基因分型过程中,MALDI-TOF与TaqMan探针方法对1例标本的分型结果不一致,经过对此分型结果进行了测序验证,MALDI-TOF的分型结果正确,MALDI-TOF在准确性和敏感度比TaqMan法稍高.位点rs2227473基因频率分析中,结核病组G等位基因频率(90.3％,722/800)明显高于对照组(82.5％,495/600)(x2=6.911,P=0.009).结论 上述肺结核易感基因的筛选方法是可行的;实例分析中,将两种方法联合应用,发现了IL-22基因rs2227473位点等位基因G可能与肺结核发病相关,两位点中等位基因A可能为保护性基因.
目的 對比分析飛行時間質譜技術(MALDI-TOF)和TaqMan探針篩選與結覈病易感性相關單覈苷痠多態性(SNP)位點的結果,以及聯閤應用的方法學和效果評價.方法 選取2010年10月至2011年4月在深圳市第三人民醫院收治併確診的結覈病患者400例為結覈病組,對照組為同時期收集的健康體檢者300名,利用MALDI-TOF對選取的7箇SNP位點(rs2227476、rs1800795、rs56077270、rs1800797、rs2227484、rs2227472和rs2227473)同時進行基因分型,初步篩選易感SNP位點;與結覈病易感相關的單箇SNP位點,採用基于TaqMan探針技術的實時熒光定量PCR對同樣的標本再進行基因分型,比較兩種方法的準確性與敏感度;以rs2227473位點為實例對分型結果的基因頻率進行分析,確定肺結覈的易感SNP.結果 MALDI-TOF分型成功率為99.7％(698/700),TaqMan探針技術為98.4％(689/700);在基因分型過程中,MALDI-TOF與TaqMan探針方法對1例標本的分型結果不一緻,經過對此分型結果進行瞭測序驗證,MALDI-TOF的分型結果正確,MALDI-TOF在準確性和敏感度比TaqMan法稍高.位點rs2227473基因頻率分析中,結覈病組G等位基因頻率(90.3％,722/800)明顯高于對照組(82.5％,495/600)(x2=6.911,P=0.009).結論 上述肺結覈易感基因的篩選方法是可行的;實例分析中,將兩種方法聯閤應用,髮現瞭IL-22基因rs2227473位點等位基因G可能與肺結覈髮病相關,兩位點中等位基因A可能為保護性基因.
목적 대비분석비행시간질보기술(MALDI-TOF)화TaqMan탐침사선여결핵병역감성상관단핵감산다태성(SNP)위점적결과,이급연합응용적방법학화효과평개.방법 선취2010년10월지2011년4월재심수시제삼인민의원수치병학진적결핵병환자400례위결핵병조,대조조위동시기수집적건강체검자300명,이용MALDI-TOF대선취적7개SNP위점(rs2227476、rs1800795、rs56077270、rs1800797、rs2227484、rs2227472화rs2227473)동시진행기인분형,초보사선역감SNP위점;여결핵병역감상관적단개SNP위점,채용기우TaqMan탐침기술적실시형광정량PCR대동양적표본재진행기인분형,비교량충방법적준학성여민감도;이rs2227473위점위실례대분형결과적기인빈솔진행분석,학정폐결핵적역감SNP.결과 MALDI-TOF분형성공솔위99.7％(698/700),TaqMan탐침기술위98.4％(689/700);재기인분형과정중,MALDI-TOF여TaqMan탐침방법대1례표본적분형결과불일치,경과대차분형결과진행료측서험증,MALDI-TOF적분형결과정학,MALDI-TOF재준학성화민감도비TaqMan법초고.위점rs2227473기인빈솔분석중,결핵병조G등위기인빈솔(90.3％,722/800)명현고우대조조(82.5％,495/600)(x2=6.911,P=0.009).결론 상술폐결핵역감기인적사선방법시가행적;실례분석중,장량충방법연합응용,발현료IL-22기인rs2227473위점등위기인G가능여폐결핵발병상관,량위점중등위기인A가능위보호성기인.
