科学技术与工程
科學技術與工程
과학기술여공정
SCIENCE TECHNOLOGY AND ENGINEERING
2014年
13期
11-15
,共5页
极端嗜盐古菌%bop基因%细菌视紫红质%最适生长条件
極耑嗜鹽古菌%bop基因%細菌視紫紅質%最適生長條件
겁단기염고균%bop기인%세균시자홍질%최괄생장조건
Halophilic archaea%bop gene%bacteriorhodopsin%optimum growth conditions
从内蒙古额吉淖尔湖分离得到一株产视紫红质的极端嗜盐古菌,初步鉴定为属于Natrinema属;并扩增出了其bop基因,该bop基因序列已在Genbank中注册,编号为KF863690,分析了其核心序列.结果表明bop基因开放阅读框为303 bp,编码101个氨基酸.blastp结果表明该蛋白属于Bac-rhodopsin蛋白家族,具有典型的细菌视紫红质蛋白结构域.利用BLAST进行相似性分析发现bop编码蛋白氨基酸序列与Genbank中编号AAS87571.1、WP-007110705和AFB77278.1的视紫红质蛋白相似性达到98％以上.此结果表明视紫红质蛋白在细菌及古菌中结构上具有很高的保守性,与其质子泵功能紧密相关.最后分析了该菌株的最适生长条件.该菌株在分离培养基中适宜生长的NaC1浓度范围为1.0～3.0 mol/L,适宜生长pH为6.5 ～8.5,适宜生长镁离子浓度为0.4～0.8 mol/L.通过分析比较得出该嗜盐古生菌株生长最适NaC1盐浓度为1.5 mol/L,最适pH值为7.5,最适镁离子浓度为0.4 mol/L.该实验结果为今后进一步研究产视紫红质的极端嗜盐古生菌株的生理生化特征及遗传学特征奠定了基础.
從內矇古額吉淖爾湖分離得到一株產視紫紅質的極耑嗜鹽古菌,初步鑒定為屬于Natrinema屬;併擴增齣瞭其bop基因,該bop基因序列已在Genbank中註冊,編號為KF863690,分析瞭其覈心序列.結果錶明bop基因開放閱讀框為303 bp,編碼101箇氨基痠.blastp結果錶明該蛋白屬于Bac-rhodopsin蛋白傢族,具有典型的細菌視紫紅質蛋白結構域.利用BLAST進行相似性分析髮現bop編碼蛋白氨基痠序列與Genbank中編號AAS87571.1、WP-007110705和AFB77278.1的視紫紅質蛋白相似性達到98％以上.此結果錶明視紫紅質蛋白在細菌及古菌中結構上具有很高的保守性,與其質子泵功能緊密相關.最後分析瞭該菌株的最適生長條件.該菌株在分離培養基中適宜生長的NaC1濃度範圍為1.0～3.0 mol/L,適宜生長pH為6.5 ～8.5,適宜生長鎂離子濃度為0.4～0.8 mol/L.通過分析比較得齣該嗜鹽古生菌株生長最適NaC1鹽濃度為1.5 mol/L,最適pH值為7.5,最適鎂離子濃度為0.4 mol/L.該實驗結果為今後進一步研究產視紫紅質的極耑嗜鹽古生菌株的生理生化特徵及遺傳學特徵奠定瞭基礎.
종내몽고액길뇨이호분리득도일주산시자홍질적겁단기염고균,초보감정위속우Natrinema속;병확증출료기bop기인,해bop기인서렬이재Genbank중주책,편호위KF863690,분석료기핵심서렬.결과표명bop기인개방열독광위303 bp,편마101개안기산.blastp결과표명해단백속우Bac-rhodopsin단백가족,구유전형적세균시자홍질단백결구역.이용BLAST진행상사성분석발현bop편마단백안기산서렬여Genbank중편호AAS87571.1、WP-007110705화AFB77278.1적시자홍질단백상사성체도98％이상.차결과표명시자홍질단백재세균급고균중결구상구유흔고적보수성,여기질자빙공능긴밀상관.최후분석료해균주적최괄생장조건.해균주재분리배양기중괄의생장적NaC1농도범위위1.0～3.0 mol/L,괄의생장pH위6.5 ～8.5,괄의생장미리자농도위0.4～0.8 mol/L.통과분석비교득출해기염고생균주생장최괄NaC1염농도위1.5 mol/L,최괄pH치위7.5,최괄미리자농도위0.4 mol/L.해실험결과위금후진일보연구산시자홍질적겁단기염고생균주적생리생화특정급유전학특정전정료기출.
