数据采集与处理
數據採集與處理
수거채집여처리
JOURNAL OF DATA ACQUISITION & PROCESSING
2014年
1期
141-145
,共5页
核小体定位%二核苷酸位置频率%连接DNA序列%核心DNA序列
覈小體定位%二覈苷痠位置頻率%連接DNA序列%覈心DNA序列
핵소체정위%이핵감산위치빈솔%련접DNA서렬%핵심DNA서렬
nucleosome positioning%dinucleotide position-frequency%linker DNA sequence%nucleosome-bound DNA sequence
核小体预测是目前遗传学研究的重要内容,但现有的预测算法大部分仅依据核小体的统计特性,定位准确性很受局限.另一方面,经研究发现,DNA连接序列作为两个核小体的连接纽带,存在一定的统计特性.基于此事实,本文对Segal模型做了改进,通过核小体和连接序列的二核苷酸位置频率建立了核小体和连接序列两组得分函数,并以其差值作为核小体的定位依据.利用该算法模型对酵母染色体中核小体进行定位预测,发现定位准确性得到明显提高.
覈小體預測是目前遺傳學研究的重要內容,但現有的預測算法大部分僅依據覈小體的統計特性,定位準確性很受跼限.另一方麵,經研究髮現,DNA連接序列作為兩箇覈小體的連接紐帶,存在一定的統計特性.基于此事實,本文對Segal模型做瞭改進,通過覈小體和連接序列的二覈苷痠位置頻率建立瞭覈小體和連接序列兩組得分函數,併以其差值作為覈小體的定位依據.利用該算法模型對酵母染色體中覈小體進行定位預測,髮現定位準確性得到明顯提高.
핵소체예측시목전유전학연구적중요내용,단현유적예측산법대부분부의거핵소체적통계특성,정위준학성흔수국한.령일방면,경연구발현,DNA련접서렬작위량개핵소체적련접뉴대,존재일정적통계특성.기우차사실,본문대Segal모형주료개진,통과핵소체화련접서렬적이핵감산위치빈솔건립료핵소체화련접서렬량조득분함수,병이기차치작위핵소체적정위의거.이용해산법모형대효모염색체중핵소체진행정위예측,발현정위준학성득도명현제고.
