江苏农业科学
江囌農業科學
강소농업과학
JIANGSU AGRICULTURAL SCIENCES
2012年
8期
18-21
,共4页
汪倩%谭德冠%吴丽娟%孙雪飘%张家明
汪倩%譚德冠%吳麗娟%孫雪飄%張傢明
왕천%담덕관%오려연%손설표%장가명
番木瓜环斑病毒%畸形花叶病毒%外壳蛋白%相似性%系统发育树
番木瓜環斑病毒%畸形花葉病毒%外殼蛋白%相似性%繫統髮育樹
번목과배반병독%기형화협병독%외각단백%상사성%계통발육수
从海南乐东的感病番木瓜叶片上提取总RNA,用RT-PCR方法扩增番木瓜环斑病毒(PRSV)外壳蛋白基因组序列.测序结果显示,该环斑病毒外壳蛋白基因扩增片段长867个核苷酸.相似性分析表明,该核苷酸序列与GenBank中报道的47株PRSV和1株畸形花叶病毒核苷酸序列的相似性在62.41％ ～94.71％之间.运用CLUSTALX和MEGA软件绘制系统进化树,结果表明,番木瓜PRSV病毒大致可分为美洲-澳洲类群和东亚-东南亚类群2大类,后者又可分为SB1、SB2、SB3等3个亚类.乐东毒株和已报到的畸形花叶病毒PaMLV病毒都属于PRSV.不过乐东毒株属于SB1亚类,而PaMLV属于SB2亚类.乐东毒株(JQ318029)和另一海南毒株(HQ424465)属于SB1亚簇,信心指数分别达到89％、83％、96％.不过乐东毒株与越南北部的4种毒株(AF506875、FN808408、AJ875115、U14742)的同源性更高,说明导致乐东畸形花叶病的毒株可能来自越南,而不是由海南本地毒株变异而来.
從海南樂東的感病番木瓜葉片上提取總RNA,用RT-PCR方法擴增番木瓜環斑病毒(PRSV)外殼蛋白基因組序列.測序結果顯示,該環斑病毒外殼蛋白基因擴增片段長867箇覈苷痠.相似性分析錶明,該覈苷痠序列與GenBank中報道的47株PRSV和1株畸形花葉病毒覈苷痠序列的相似性在62.41％ ～94.71％之間.運用CLUSTALX和MEGA軟件繪製繫統進化樹,結果錶明,番木瓜PRSV病毒大緻可分為美洲-澳洲類群和東亞-東南亞類群2大類,後者又可分為SB1、SB2、SB3等3箇亞類.樂東毒株和已報到的畸形花葉病毒PaMLV病毒都屬于PRSV.不過樂東毒株屬于SB1亞類,而PaMLV屬于SB2亞類.樂東毒株(JQ318029)和另一海南毒株(HQ424465)屬于SB1亞簇,信心指數分彆達到89％、83％、96％.不過樂東毒株與越南北部的4種毒株(AF506875、FN808408、AJ875115、U14742)的同源性更高,說明導緻樂東畸形花葉病的毒株可能來自越南,而不是由海南本地毒株變異而來.
종해남악동적감병번목과협편상제취총RNA,용RT-PCR방법확증번목과배반병독(PRSV)외각단백기인조서렬.측서결과현시,해배반병독외각단백기인확증편단장867개핵감산.상사성분석표명,해핵감산서렬여GenBank중보도적47주PRSV화1주기형화협병독핵감산서렬적상사성재62.41％ ～94.71％지간.운용CLUSTALX화MEGA연건회제계통진화수,결과표명,번목과PRSV병독대치가분위미주-오주류군화동아-동남아류군2대류,후자우가분위SB1、SB2、SB3등3개아류.악동독주화이보도적기형화협병독PaMLV병독도속우PRSV.불과악동독주속우SB1아류,이PaMLV속우SB2아류.악동독주(JQ318029)화령일해남독주(HQ424465)속우SB1아족,신심지수분별체도89％、83％、96％.불과악동독주여월남북부적4충독주(AF506875、FN808408、AJ875115、U14742)적동원성경고,설명도치악동기형화협병적독주가능래자월남,이불시유해남본지독주변이이래.
