CAJ | 학술논문

目的:通过生物信息学分析人乳腺癌相关基因环氧化酶2(Cycloxygenase 2,COX-2)编码蛋白的主要特性与抗原表位,筛选该蛋白的T/B细胞联合表位.方法:利用蛋白分析专家系统(ExPASy)提供的Prot-Param、SignalP、SOSUI、TMHMM、MotifScan,NCBI上的ORF finder、Bcepred、SYFPEITHI、NetCTL等生物信息学在线分析程序,结合Gene Runner、DNAMAN等生物信息学软件,分析、预测COX-2蛋白的理化性质、信号肽、可溶性、表面可及性、可塑性,跨膜区,翻译后修饰位点、亲(疏)水性、二级结构、T/B细胞抗原表位等.结果:该蛋白由604个氨基酸组成,分子式为C3126H4787N823O883S28,分子质量单位为68.924 kDa,等电点理论值为7.27,波长280 nm时的吸光度(A)值为1.073,半衰期为30 h,有7个表面可及性参数≥1.9的区域、4个亲水性参数得分≥1.9的区域、3个柔韧性参数得分≥2的区域、26个翻译后修饰位点、23个潜在B细胞表位、3个CTL表位和辅助性T细胞联合表位、2个T/B细胞联合表位,为可溶性表达蛋白.结论:人乳腺癌相关抗原COX-2基因编码的COX-2蛋白为可溶性表达蛋白,2个T/B细胞联合表位,可作为乳腺癌免疫学治疗的重要靶点.
목적:통과생물신식학분석인유선암상관기인배양화매2(Cycloxygenase 2,COX-2)편마단백적주요특성여항원표위,사선해단백적T/B세포연합표위.방법:이용단백분석전가계통(ExPASy)제공적Prot-Param、SignalP、SOSUI、TMHMM、MotifScan,NCBI상적ORF finder、Bcepred、SYFPEITHI、NetCTL등생물신식학재선분석정서,결합Gene Runner、DNAMAN등생물신식학연건,분석、예측COX-2단백적이화성질、신호태、가용성、표면가급성、가소성,과막구,번역후수식위점、친(소)수성、이급결구、T/B세포항원표위등.결과:해단백유604개안기산조성,분자식위C3126H4787N823O883S28,분자질량단위위68.924 kDa,등전점이론치위7.27,파장280 nm시적흡광도(A)치위1.073,반쇠기위30 h,유7개표면가급성삼수≥1.9적구역、4개친수성삼수득분≥1.9적구역、3개유인성삼수득분≥2적구역、26개번역후수식위점、23개잠재B세포표위、3개CTL표위화보조성T세포연합표위、2개T/B세포연합표위,위가용성표체단백.결론:인유선암상관항원COX-2기인편마적COX-2단백위가용성표체단백,2개T/B세포연합표위,가작위유선암면역학치료적중요파점.