广西科学
廣西科學
엄서과학
GUANGXI SCIENCES
2013年
3期
239-243
,共5页
赵高超%古恒森%谢雨龙%黄捷%陈高%武波%蒋承建
趙高超%古恆森%謝雨龍%黃捷%陳高%武波%蔣承建
조고초%고항삼%사우룡%황첩%진고%무파%장승건
宏基因组文库%预苯酸脱氢酶%基因%多肽
宏基因組文庫%預苯痠脫氫酶%基因%多肽
굉기인조문고%예분산탈경매%기인%다태
metagenomic library%prephenate dehydrogenase%gene%peptide
采用基于序列特异性直接测序策略,从所构建的碱性污染土壤宏基因组文库中分离得到一个编码预苯酸脱氢酶的新基因pdhE-1,并对新基因进行生物信息学分析和保守区域特征研究.结果表明,pdhE-1编码一个由287个氨基酸编码组成的多肽.在DNA水平上,该基因与来自新鞘氨醇杆菌属(Novosphingobium sp.)的预苯酸脱氢酶相似性较高,为82％；在氨基酸水平上,与来自运动发酵单胞菌(Zymomonas mobilis)的预苯酸脱氢酶序列相似性为65％,一致性为42％.新型预苯酸脱氢酶基因pdhE-1的克隆和生物信息学分析研究为进一步完成酶基因的功能鉴定奠定了基础.
採用基于序列特異性直接測序策略,從所構建的堿性汙染土壤宏基因組文庫中分離得到一箇編碼預苯痠脫氫酶的新基因pdhE-1,併對新基因進行生物信息學分析和保守區域特徵研究.結果錶明,pdhE-1編碼一箇由287箇氨基痠編碼組成的多肽.在DNA水平上,該基因與來自新鞘氨醇桿菌屬(Novosphingobium sp.)的預苯痠脫氫酶相似性較高,為82％；在氨基痠水平上,與來自運動髮酵單胞菌(Zymomonas mobilis)的預苯痠脫氫酶序列相似性為65％,一緻性為42％.新型預苯痠脫氫酶基因pdhE-1的剋隆和生物信息學分析研究為進一步完成酶基因的功能鑒定奠定瞭基礎.
채용기우서렬특이성직접측서책략,종소구건적감성오염토양굉기인조문고중분리득도일개편마예분산탈경매적신기인pdhE-1,병대신기인진행생물신식학분석화보수구역특정연구.결과표명,pdhE-1편마일개유287개안기산편마조성적다태.재DNA수평상,해기인여래자신초안순간균속(Novosphingobium sp.)적예분산탈경매상사성교고,위82％；재안기산수평상,여래자운동발효단포균(Zymomonas mobilis)적예분산탈경매서렬상사성위65％,일치성위42％.신형예분산탈경매기인pdhE-1적극륭화생물신식학분석연구위진일보완성매기인적공능감정전정료기출.
