中华妇幼临床医学杂志（电子版）
中華婦幼臨床醫學雜誌（電子版）
중화부유림상의학잡지（전자판）
CHINESE JOURNAL OF OBSTETRICS & GYNECOLOGY AND PEDIATRICS(ELECTRONIC VERSION)
2013年
4期
378-381
,共4页
伍苑宾%胡兢晶%王波%苏海浩%郭媛媛%谢斌华%密英鸽
伍苑賓%鬍兢晶%王波%囌海浩%郭媛媛%謝斌華%密英鴿
오원빈%호긍정%왕파%소해호%곽원원%사빈화%밀영합
人巨细胞病毒%UL148%B细胞表位%多肽免疫
人巨細胞病毒%UL148%B細胞錶位%多肽免疫
인거세포병독%UL148%B세포표위%다태면역
human cytomegalovirus%UL148%B-cell epitope%multi-peptide immunization
目的 预测与分析人巨细胞病毒(HCMV)临床病毒株UL148基因B细胞表位.方法 应用生物信息学方法,以HCMV UL148基因氨基酸序列为基础,采用改进型自我优化预测结构(SOPMA),Garnier-Osguthorpe-Robson (GOR),人工神经网络预测法(HNN)预测二级结构,结合跨膜结构、Hopp＆Woods亲水性方案、Emini可及性方案、Jameson-Wolf抗原性方案等参数综合预测UL148基因B细胞表位.结果 HCMV pUL148氨基酸包含316个氨基酸残基,相对分子质量为36 kD,等电点为9.15;应用SOPMA,GOR,HNN方案预测pUL148二级结构,均显示以α-螺旋为主,无规则卷及β-转角区域多位于14～21,98～106,132～139,174～181,191～197,267～272,235～240.TMHMM预测pUL148存在一个跨膜区域,为286～308位氨基酸,胞外区域为1～285位氨基酸.结论 HCMV UL148基因265～275,221～229,18～25位氨基酸序列区域内或其附近主要以无规则卷或β-转角结构为主,且抗原指数(AI)较高,极有可能是B细胞表位.
目的 預測與分析人巨細胞病毒(HCMV)臨床病毒株UL148基因B細胞錶位.方法 應用生物信息學方法,以HCMV UL148基因氨基痠序列為基礎,採用改進型自我優化預測結構(SOPMA),Garnier-Osguthorpe-Robson (GOR),人工神經網絡預測法(HNN)預測二級結構,結閤跨膜結構、Hopp＆Woods親水性方案、Emini可及性方案、Jameson-Wolf抗原性方案等參數綜閤預測UL148基因B細胞錶位.結果 HCMV pUL148氨基痠包含316箇氨基痠殘基,相對分子質量為36 kD,等電點為9.15;應用SOPMA,GOR,HNN方案預測pUL148二級結構,均顯示以α-螺鏇為主,無規則捲及β-轉角區域多位于14～21,98～106,132～139,174～181,191～197,267～272,235～240.TMHMM預測pUL148存在一箇跨膜區域,為286～308位氨基痠,胞外區域為1～285位氨基痠.結論 HCMV UL148基因265～275,221～229,18～25位氨基痠序列區域內或其附近主要以無規則捲或β-轉角結構為主,且抗原指數(AI)較高,極有可能是B細胞錶位.
목적 예측여분석인거세포병독(HCMV)림상병독주UL148기인B세포표위.방법 응용생물신식학방법,이HCMV UL148기인안기산서렬위기출,채용개진형자아우화예측결구(SOPMA),Garnier-Osguthorpe-Robson (GOR),인공신경망락예측법(HNN)예측이급결구,결합과막결구、Hopp＆Woods친수성방안、Emini가급성방안、Jameson-Wolf항원성방안등삼수종합예측UL148기인B세포표위.결과 HCMV pUL148안기산포함316개안기산잔기,상대분자질량위36 kD,등전점위9.15;응용SOPMA,GOR,HNN방안예측pUL148이급결구,균현시이α-라선위주,무규칙권급β-전각구역다위우14～21,98～106,132～139,174～181,191～197,267～272,235～240.TMHMM예측pUL148존재일개과막구역,위286～308위안기산,포외구역위1～285위안기산.결론 HCMV UL148기인265～275,221～229,18～25위안기산서렬구역내혹기부근주요이무규칙권혹β-전각결구위주,차항원지수(AI)교고,겁유가능시B세포표위.
