江西农业大学学报
江西農業大學學報
강서농업대학학보
ACTA AGRICULTURAE UNIVERSITATIS JIANGXIENSIS
2013年
4期
807-812
,共6页
杨月莹%刘娣%丁常宏%祁雪莲
楊月瑩%劉娣%丁常宏%祁雪蓮
양월형%류제%정상굉%기설련
基因表达谱%目标优化%低温胁迫%特征选择
基因錶達譜%目標優化%低溫脅迫%特徵選擇
기인표체보%목표우화%저온협박%특정선택
gene chip%optimization algorithm%low temperature stress%feature selection
随着基因芯片在基因的发现与识别等研究方面的应用,高通量并行识别特征基因成为表达谱分析的重要工作之一.地方猪种民猪在抗寒性方面表现出较好的生物特征,提出的目标优化方法在识别民猪抗寒性状相关基因方面效果较好.通过制备常温状态和低温状态两类样本的基因芯片,获得了民猪低温胁迫的表达谱数据,通过目标优化算法多次迭代筛选得到的特征基因集合,对于不同的特征基因集合的分析,最终确定民猪抗寒性状相关基因,注释在生物学数据库中获得了相应的基因功能.目标优化算法泛化性能较好,能够同步进行特征基因的选择和样本分类两过程.
隨著基因芯片在基因的髮現與識彆等研究方麵的應用,高通量併行識彆特徵基因成為錶達譜分析的重要工作之一.地方豬種民豬在抗寒性方麵錶現齣較好的生物特徵,提齣的目標優化方法在識彆民豬抗寒性狀相關基因方麵效果較好.通過製備常溫狀態和低溫狀態兩類樣本的基因芯片,穫得瞭民豬低溫脅迫的錶達譜數據,通過目標優化算法多次迭代篩選得到的特徵基因集閤,對于不同的特徵基因集閤的分析,最終確定民豬抗寒性狀相關基因,註釋在生物學數據庫中穫得瞭相應的基因功能.目標優化算法汎化性能較好,能夠同步進行特徵基因的選擇和樣本分類兩過程.
수착기인심편재기인적발현여식별등연구방면적응용,고통량병행식별특정기인성위표체보분석적중요공작지일.지방저충민저재항한성방면표현출교호적생물특정,제출적목표우화방법재식별민저항한성상상관기인방면효과교호.통과제비상온상태화저온상태량류양본적기인심편,획득료민저저온협박적표체보수거,통과목표우화산법다차질대사선득도적특정기인집합,대우불동적특정기인집합적분석,최종학정민저항한성상상관기인,주석재생물학수거고중획득료상응적기인공능.목표우화산법범화성능교호,능구동보진행특정기인적선택화양본분류량과정.
