遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2014年
2期
135-144
,共10页
于雪%于红%孔令锋%李琪
于雪%于紅%孔令鋒%李琪
우설%우홍%공령봉%리기
太平洋牡蛎%酪氨酸酶%分类%系统发生
太平洋牡蠣%酪氨痠酶%分類%繫統髮生
태평양모려%락안산매%분류%계통발생
Crassostrea gigas%tyrosinase%classification%phylogeny
文章利用生物信息学方法对太平洋牡蛎(Crassostrea gigas Thunberg)酪氨酸酶基因家族的氨基酸序列特征、分类及系统发生进行了分析.结果表明,太平洋牡蛎酪氨酸酶基因家族在进化过程中存在基因扩张现象,其主要方式是基因重复.太平洋牡蛎酪氨酸酶可分为3种类型:分泌型(Type A),胞内型(Type B)和具跨膜结构域型(Type C).根据太平洋牡蛎酪氨酸酶进化树分析,发现Type A酪氨酸酶中,tyrl8与其他Type A酪氨酸酶分化较大,可能是较早分化出来的酪氨酸酶;Type B酪氨酸中的tyr2和tyr9以及Type C中的tyr8为较早分化出的酪氨酸酶.系统发生树分析发现太平洋牡蛎酪氨酸酶的聚类受酪氨酸酶类型以及基因位置的影响,其分泌型酪氨酸酶首先与头足类分泌型酪氨酸酶聚在一起,然后与线形动物门分泌型酪氨酸酶聚在一起,与腔肠动物门分泌型酪氨酸酶分化明显.太平洋牡蛎胞内型酪氨酸酶自身分化较大,总体上与线性动物门、其他软体动物胞内型酪氨酸酶聚为一支,与扁形动物门、脊索动物门、腔肠动物门胞内型酪氨酸酶分化较大.太平洋牡蛎具跨膜结构域型酪氨酸酶与扁形动物门、环形动物门以及脊索动物门具跨膜结构域型酪氨酸酶分化明显,与合浦珠母贝具跨膜结构域型酪氨酸酶聚为一支.这表明双壳类的Type C型酪氨酸酶与其他物种的同源酶的进化差异较大.文章首次探讨了太平洋牡蛎酪氨酸酶家族分类、分化及系统发生,以期对太平洋牡蛎酪氨酸酶基因家族的理论研究和实际应用提供依据.
文章利用生物信息學方法對太平洋牡蠣(Crassostrea gigas Thunberg)酪氨痠酶基因傢族的氨基痠序列特徵、分類及繫統髮生進行瞭分析.結果錶明,太平洋牡蠣酪氨痠酶基因傢族在進化過程中存在基因擴張現象,其主要方式是基因重複.太平洋牡蠣酪氨痠酶可分為3種類型:分泌型(Type A),胞內型(Type B)和具跨膜結構域型(Type C).根據太平洋牡蠣酪氨痠酶進化樹分析,髮現Type A酪氨痠酶中,tyrl8與其他Type A酪氨痠酶分化較大,可能是較早分化齣來的酪氨痠酶;Type B酪氨痠中的tyr2和tyr9以及Type C中的tyr8為較早分化齣的酪氨痠酶.繫統髮生樹分析髮現太平洋牡蠣酪氨痠酶的聚類受酪氨痠酶類型以及基因位置的影響,其分泌型酪氨痠酶首先與頭足類分泌型酪氨痠酶聚在一起,然後與線形動物門分泌型酪氨痠酶聚在一起,與腔腸動物門分泌型酪氨痠酶分化明顯.太平洋牡蠣胞內型酪氨痠酶自身分化較大,總體上與線性動物門、其他軟體動物胞內型酪氨痠酶聚為一支,與扁形動物門、脊索動物門、腔腸動物門胞內型酪氨痠酶分化較大.太平洋牡蠣具跨膜結構域型酪氨痠酶與扁形動物門、環形動物門以及脊索動物門具跨膜結構域型酪氨痠酶分化明顯,與閤浦珠母貝具跨膜結構域型酪氨痠酶聚為一支.這錶明雙殼類的Type C型酪氨痠酶與其他物種的同源酶的進化差異較大.文章首次探討瞭太平洋牡蠣酪氨痠酶傢族分類、分化及繫統髮生,以期對太平洋牡蠣酪氨痠酶基因傢族的理論研究和實際應用提供依據.
문장이용생물신식학방법대태평양모려(Crassostrea gigas Thunberg)락안산매기인가족적안기산서렬특정、분류급계통발생진행료분석.결과표명,태평양모려락안산매기인가족재진화과정중존재기인확장현상,기주요방식시기인중복.태평양모려락안산매가분위3충류형:분비형(Type A),포내형(Type B)화구과막결구역형(Type C).근거태평양모려락안산매진화수분석,발현Type A락안산매중,tyrl8여기타Type A락안산매분화교대,가능시교조분화출래적락안산매;Type B락안산중적tyr2화tyr9이급Type C중적tyr8위교조분화출적락안산매.계통발생수분석발현태평양모려락안산매적취류수락안산매류형이급기인위치적영향,기분비형락안산매수선여두족류분비형락안산매취재일기,연후여선형동물문분비형락안산매취재일기,여강장동물문분비형락안산매분화명현.태평양모려포내형락안산매자신분화교대,총체상여선성동물문、기타연체동물포내형락안산매취위일지,여편형동물문、척색동물문、강장동물문포내형락안산매분화교대.태평양모려구과막결구역형락안산매여편형동물문、배형동물문이급척색동물문구과막결구역형락안산매분화명현,여합포주모패구과막결구역형락안산매취위일지.저표명쌍각류적Type C형락안산매여기타물충적동원매적진화차이교대.문장수차탐토료태평양모려락안산매가족분류、분화급계통발생,이기대태평양모려락안산매기인가족적이론연구화실제응용제공의거.