成都电子机械高等专科学校学报
成都電子機械高等專科學校學報
성도전자궤계고등전과학교학보
CHENGDU ELECTROMECHANICAL COLLEGE
2012年
4期
10-14
,共5页
娄永锋%肖蓉%向明礼%杨明理
婁永鋒%肖蓉%嚮明禮%楊明理
루영봉%초용%향명례%양명리
咪唑环芳%分子动力学%密度泛函理论%分子识别
咪唑環芳%分子動力學%密度汎函理論%分子識彆
미서배방%분자동역학%밀도범함이론%분자식별
采用Gaussian 03在B3LYP/6-31G (d)水平上分别优化新型多苯并咪唑环芳(MBICP)受体和氨基酸甲酯(AAME)配体,再用基于模拟退火的分子动力学方法CDOCKER将配体与受体对接,对每一个复合物获得了一组最低能量的初始构象.最后用Turbomole在BLYP/def-TZVP水平对初始构象进一步优化,并对收敛后的复合物最低能量构象作NBO分析.以密度泛函理论计算获得的相互作用能作为核心参数,采用组合策略建立了表达MBICP-AAME复合物结合常数的定量关系模型,计算了该类复合物的结合常数.对MBICP受体和AAME配体间的作用模式以及影响MBICP受体识别AAME配体的主要因素,作了深入讨论.
採用Gaussian 03在B3LYP/6-31G (d)水平上分彆優化新型多苯併咪唑環芳(MBICP)受體和氨基痠甲酯(AAME)配體,再用基于模擬退火的分子動力學方法CDOCKER將配體與受體對接,對每一箇複閤物穫得瞭一組最低能量的初始構象.最後用Turbomole在BLYP/def-TZVP水平對初始構象進一步優化,併對收斂後的複閤物最低能量構象作NBO分析.以密度汎函理論計算穫得的相互作用能作為覈心參數,採用組閤策略建立瞭錶達MBICP-AAME複閤物結閤常數的定量關繫模型,計算瞭該類複閤物的結閤常數.對MBICP受體和AAME配體間的作用模式以及影響MBICP受體識彆AAME配體的主要因素,作瞭深入討論.
채용Gaussian 03재B3LYP/6-31G (d)수평상분별우화신형다분병미서배방(MBICP)수체화안기산갑지(AAME)배체,재용기우모의퇴화적분자동역학방법CDOCKER장배체여수체대접,대매일개복합물획득료일조최저능량적초시구상.최후용Turbomole재BLYP/def-TZVP수평대초시구상진일보우화,병대수렴후적복합물최저능량구상작NBO분석.이밀도범함이론계산획득적상호작용능작위핵심삼수,채용조합책략건립료표체MBICP-AAME복합물결합상수적정량관계모형,계산료해류복합물적결합상수.대MBICP수체화AAME배체간적작용모식이급영향MBICP수체식별AAME배체적주요인소,작료심입토론.