中南林业科技大学学报
中南林業科技大學學報
중남임업과기대학학보
JOURNAL OF CENTRAL SOUTH UNIVERSITY OF FORESTRY & TECHNOLOGY
2012年
11期
122-130
,共9页
李铁柱%杜红岩%刘慧敏%乌云塔娜%王淋%叶生晶
李鐵柱%杜紅巖%劉慧敏%烏雲塔娜%王淋%葉生晶
리철주%두홍암%류혜민%오운탑나%왕림%협생정
杜仲%果实%叶片%转录组%基因功能
杜仲%果實%葉片%轉錄組%基因功能
두중%과실%협편%전록조%기인공능
所构建的杜仲果实和叶片转录组数据库获得了54 471 338条reads数据,包含4 902 420 420nt数据信息,对reads进行拼接,获得了452 421条Contig,总长度为90 705 736 nt;对contig进行拼接后,获得了147 027条Scaffold,总长度为65 877 052 nt;同理,对Scaffold进一步拼接后,获得了49 610条Unigene,总长度为37616 729 nt; Unigene和COG数据库进行比对表明,杜仲果实和叶片转录组中的Unigene根据功能大致可分为25类；杜仲果实和叶片转录组中的Unigene根据GO功能可分为生物过程、细胞组分和分子功能3大类42分支；以KEGG数据库为参考,依据代谢通路可以将转录组中的数据分成125类,包括脂类代谢,DNA剪切,植物激素生物合成,苯丙氨酸生物合成,萜类化合物与类固醇类化合物合成等.
所構建的杜仲果實和葉片轉錄組數據庫穫得瞭54 471 338條reads數據,包含4 902 420 420nt數據信息,對reads進行拼接,穫得瞭452 421條Contig,總長度為90 705 736 nt;對contig進行拼接後,穫得瞭147 027條Scaffold,總長度為65 877 052 nt;同理,對Scaffold進一步拼接後,穫得瞭49 610條Unigene,總長度為37616 729 nt; Unigene和COG數據庫進行比對錶明,杜仲果實和葉片轉錄組中的Unigene根據功能大緻可分為25類；杜仲果實和葉片轉錄組中的Unigene根據GO功能可分為生物過程、細胞組分和分子功能3大類42分支；以KEGG數據庫為參攷,依據代謝通路可以將轉錄組中的數據分成125類,包括脂類代謝,DNA剪切,植物激素生物閤成,苯丙氨痠生物閤成,萜類化閤物與類固醇類化閤物閤成等.
소구건적두중과실화협편전록조수거고획득료54 471 338조reads수거,포함4 902 420 420nt수거신식,대reads진행병접,획득료452 421조Contig,총장도위90 705 736 nt;대contig진행병접후,획득료147 027조Scaffold,총장도위65 877 052 nt;동리,대Scaffold진일보병접후,획득료49 610조Unigene,총장도위37616 729 nt; Unigene화COG수거고진행비대표명,두중과실화협편전록조중적Unigene근거공능대치가분위25류；두중과실화협편전록조중적Unigene근거GO공능가분위생물과정、세포조분화분자공능3대류42분지；이KEGG수거고위삼고,의거대사통로가이장전록조중적수거분성125류,포괄지류대사,DNA전절,식물격소생물합성,분병안산생물합성,첩류화합물여류고순류화합물합성등.
