家畜生态学报
傢畜生態學報
가축생태학보
ACTA ECOLOGAE ANIMALIS DOMASTICI
2012年
6期
11-15
,共5页
杨辉%艾闽%李锋刚%刘小林%王立新
楊輝%艾閩%李鋒剛%劉小林%王立新
양휘%애민%리봉강%류소림%왕립신
大鲵%α1-血红蛋白%生物信息学分析%组织表达
大鯢%α1-血紅蛋白%生物信息學分析%組織錶達
대예%α1-혈홍단백%생물신식학분석%조직표체
从大鲵皮肤cDNA文库中分离获得大鲵α1-血红蛋白基因全长cDNA序列,生物信息学分析表明,大鲵α-血红蛋白基因全长cDNA序列为594 bp,开放阅读框共432 bp,编码144个氨基酸,编码的大鲵α1-血红蛋白推测的理论分子量为16.05 kDa,等电点为6.44.氨基酸组成中酸性氨基酸11.9%,中性氨基酸69.9%,碱性氨基酸18.2%.结构分析表明,该蛋白没有信号肽,但在100~122个氨基酸处以及98~122个氨基酸处分别有由里向外、由外向里的跨膜螺旋区,二级结构以α-螺旋为主.氨基酸序进行同源性列比对表明与人、猕猴的亲缘关系最近,和牛蛙的亲缘关系最低只有35%.荧光定量PCR结果表明,α1-血红蛋白基因在肌肉中表达量最高,在胃中最低.
從大鯢皮膚cDNA文庫中分離穫得大鯢α1-血紅蛋白基因全長cDNA序列,生物信息學分析錶明,大鯢α-血紅蛋白基因全長cDNA序列為594 bp,開放閱讀框共432 bp,編碼144箇氨基痠,編碼的大鯢α1-血紅蛋白推測的理論分子量為16.05 kDa,等電點為6.44.氨基痠組成中痠性氨基痠11.9%,中性氨基痠69.9%,堿性氨基痠18.2%.結構分析錶明,該蛋白沒有信號肽,但在100~122箇氨基痠處以及98~122箇氨基痠處分彆有由裏嚮外、由外嚮裏的跨膜螺鏇區,二級結構以α-螺鏇為主.氨基痠序進行同源性列比對錶明與人、獼猴的親緣關繫最近,和牛蛙的親緣關繫最低隻有35%.熒光定量PCR結果錶明,α1-血紅蛋白基因在肌肉中錶達量最高,在胃中最低.
종대예피부cDNA문고중분리획득대예α1-혈홍단백기인전장cDNA서렬,생물신식학분석표명,대예α-혈홍단백기인전장cDNA서렬위594 bp,개방열독광공432 bp,편마144개안기산,편마적대예α1-혈홍단백추측적이론분자량위16.05 kDa,등전점위6.44.안기산조성중산성안기산11.9%,중성안기산69.9%,감성안기산18.2%.결구분석표명,해단백몰유신호태,단재100~122개안기산처이급98~122개안기산처분별유유리향외、유외향리적과막라선구,이급결구이α-라선위주.안기산서진행동원성렬비대표명여인、미후적친연관계최근,화우와적친연관계최저지유35%.형광정량PCR결과표명,α1-혈홍단백기인재기육중표체량최고,재위중최저.