河北联合大学学报（自然科学版）
河北聯閤大學學報（自然科學版）
하북연합대학학보（자연과학판）
Journal of Hebei United university natural sclence edition
2013年
1期
92-96,102
,共6页
黄世栋%冀洪芳%聂旋%成婷婷%杨艳梅%王金鹏
黃世棟%冀洪芳%聶鏇%成婷婷%楊豔梅%王金鵬
황세동%기홍방%섭선%성정정%양염매%왕금붕
固氮基因%比较基因组学%基因培增%系统发育树
固氮基因%比較基因組學%基因培增%繫統髮育樹
고담기인%비교기인조학%기인배증%계통발육수
以模式植物Lotus japonicus基因组为研究对象,首先应用了现有生物信息学软件BLAST程序对Lotus japonicus的全基因组序列进行了比较分析,鉴定两个序列之间的相似性并将其基因筛选出来；其次结合Blastp的数据结果提供的基因同源信息,和基因在染色体上的位置信息,对其全基因组进行共线性分析确定基因组中由WGD产生的重复基因有2197对,以获得Lotus japonicus多倍化发生的规模高达28.05％；再次在NCBI上初步搜索并获得与共生固氮相关的基因序列有12个同时根据获得的共生固氮相关的基因在四个禾本科物种中进行比较分析,并且对其进行了简单的系统进化分析,发现全基因组倍增可能有利于共生固氮相关的基因家族的扩增.
以模式植物Lotus japonicus基因組為研究對象,首先應用瞭現有生物信息學軟件BLAST程序對Lotus japonicus的全基因組序列進行瞭比較分析,鑒定兩箇序列之間的相似性併將其基因篩選齣來；其次結閤Blastp的數據結果提供的基因同源信息,和基因在染色體上的位置信息,對其全基因組進行共線性分析確定基因組中由WGD產生的重複基因有2197對,以穫得Lotus japonicus多倍化髮生的規模高達28.05％；再次在NCBI上初步搜索併穫得與共生固氮相關的基因序列有12箇同時根據穫得的共生固氮相關的基因在四箇禾本科物種中進行比較分析,併且對其進行瞭簡單的繫統進化分析,髮現全基因組倍增可能有利于共生固氮相關的基因傢族的擴增.
이모식식물Lotus japonicus기인조위연구대상,수선응용료현유생물신식학연건BLAST정서대Lotus japonicus적전기인조서렬진행료비교분석,감정량개서렬지간적상사성병장기기인사선출래；기차결합Blastp적수거결과제공적기인동원신식,화기인재염색체상적위치신식,대기전기인조진행공선성분석학정기인조중유WGD산생적중복기인유2197대,이획득Lotus japonicus다배화발생적규모고체28.05％；재차재NCBI상초보수색병획득여공생고담상관적기인서렬유12개동시근거획득적공생고담상관적기인재사개화본과물충중진행비교분석,병차대기진행료간단적계통진화분석,발현전기인조배증가능유리우공생고담상관적기인가족적확증.
