遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2013年
11期
1317-1326
,共10页
彭立新%孙菲菲%黄艳燕%黎贞崇
彭立新%孫菲菲%黃豔燕%黎貞崇
팽립신%손비비%황염연%려정숭
酿酒酵母%亚硫酸盐转运蛋白%适应性进化
釀酒酵母%亞硫痠鹽轉運蛋白%適應性進化
양주효모%아류산염전운단백%괄응성진화
Saccharomyce cerevisiae%SSU1%adaptive evolution
SSU1基因是涉及亚硫酸外排及SO2耐受性的重要因素之一.为了研究酿酒酵母(Saccharomyce cerevisiae)中SSU1对SO2耐受性及其分化机制,文章探讨了SSU1基因在酿酒酵母中的遗传特征及进化规律.基于SSU1基因序列的聚类分析表明,酿酒酵母群体可通过该基因分为3个亚群,且与其分离的地理位置无关;基于群体数据的McDonald-Kreitman检验表明,SSU1基因在酿酒酵母中受到适应性选择的作用;Ka/Ks检验表明,在酿酒酵母中,不同的亚群间有Ka/Ks显著大于1的值,且PAML的支系模型检验到正选择作用在群体中特定的支系上;PAML的支系-位点模型检验获得9个潜在正选择作用位点,其中有4个发生在受正选择作用的特定支系中;基于ssu1p蛋白结构的分析表明,在特定支系存在的正选择作用位点中,除345(R/K)位点上两氨基酸替换均为碱性氨基酸外,其他3个位点均是极性氨基酸/疏水性氨基酸之间替换,考虑不同区域的氨基酸pKa值对其维持正常的功能有着重要的作用,在该类位点的替换可能影响到ssu1p蛋白对SO2的转运作用.
SSU1基因是涉及亞硫痠外排及SO2耐受性的重要因素之一.為瞭研究釀酒酵母(Saccharomyce cerevisiae)中SSU1對SO2耐受性及其分化機製,文章探討瞭SSU1基因在釀酒酵母中的遺傳特徵及進化規律.基于SSU1基因序列的聚類分析錶明,釀酒酵母群體可通過該基因分為3箇亞群,且與其分離的地理位置無關;基于群體數據的McDonald-Kreitman檢驗錶明,SSU1基因在釀酒酵母中受到適應性選擇的作用;Ka/Ks檢驗錶明,在釀酒酵母中,不同的亞群間有Ka/Ks顯著大于1的值,且PAML的支繫模型檢驗到正選擇作用在群體中特定的支繫上;PAML的支繫-位點模型檢驗穫得9箇潛在正選擇作用位點,其中有4箇髮生在受正選擇作用的特定支繫中;基于ssu1p蛋白結構的分析錶明,在特定支繫存在的正選擇作用位點中,除345(R/K)位點上兩氨基痠替換均為堿性氨基痠外,其他3箇位點均是極性氨基痠/疏水性氨基痠之間替換,攷慮不同區域的氨基痠pKa值對其維持正常的功能有著重要的作用,在該類位點的替換可能影響到ssu1p蛋白對SO2的轉運作用.
SSU1기인시섭급아류산외배급SO2내수성적중요인소지일.위료연구양주효모(Saccharomyce cerevisiae)중SSU1대SO2내수성급기분화궤제,문장탐토료SSU1기인재양주효모중적유전특정급진화규률.기우SSU1기인서렬적취류분석표명,양주효모군체가통과해기인분위3개아군,차여기분리적지리위치무관;기우군체수거적McDonald-Kreitman검험표명,SSU1기인재양주효모중수도괄응성선택적작용;Ka/Ks검험표명,재양주효모중,불동적아군간유Ka/Ks현저대우1적치,차PAML적지계모형검험도정선택작용재군체중특정적지계상;PAML적지계-위점모형검험획득9개잠재정선택작용위점,기중유4개발생재수정선택작용적특정지계중;기우ssu1p단백결구적분석표명,재특정지계존재적정선택작용위점중,제345(R/K)위점상량안기산체환균위감성안기산외,기타3개위점균시겁성안기산/소수성안기산지간체환,고필불동구역적안기산pKa치대기유지정상적공능유착중요적작용,재해류위점적체환가능영향도ssu1p단백대SO2적전운작용.
