遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2014年
1期
85-93
,共9页
陈竹锋%严维%王娜%张文辉%谢刚%卢嘉威%简智华%刘东风%唐晓艳
陳竹鋒%嚴維%王娜%張文輝%謝剛%盧嘉威%簡智華%劉東風%唐曉豔
진죽봉%엄유%왕나%장문휘%사강%로가위%간지화%류동풍%당효염
水稻(Oryza sativa L.)%突变体%雄性不育%MutMap%剪切识别位点
水稻(Oryza sativa L.)%突變體%雄性不育%MutMap%剪切識彆位點
수도(Oryza sativa L.)%돌변체%웅성불육%MutMap%전절식별위점
通过对籼稻黄华占EMS(甲磺酸乙酯)诱变,筛选得到一隐性核不育的水稻雄性不育突变体osms55,遗传分析表明该突变体为单基因控制的隐性核不育,采用高通量的Illumina Infinium iSelect SNP(50 K)芯片检测技术鉴定该突变体的遗传背景,确认该突变体的遗传背景与黄华占一致.文章利用改进的MutMap方法成功克隆该雄性不育基因,突变位点与突变表型的共分离分析表明LOC_Os02g40450(MER3)是控制osms55突变体雄性不育的基因,该基因的剪切识别位点发生变异后导致剪切异常,造成第5外显子缺失15个碱基,从而产生雄性不育.改进的MutMap方法无需精确组装的野生型基因组序列作对照,而是通过将定位群体中有突变表型植株的DNA pool和野生型植株DNA的重测序结果分别与日本晴参考基因组进行比对,然后再比较突变体和野生型的差异SNP来确定候选基因,该方法大大降低了野生型基因组测序和组装成本,进一步扩大了MutMap方法的应用范围.
通過對秈稻黃華佔EMS(甲磺痠乙酯)誘變,篩選得到一隱性覈不育的水稻雄性不育突變體osms55,遺傳分析錶明該突變體為單基因控製的隱性覈不育,採用高通量的Illumina Infinium iSelect SNP(50 K)芯片檢測技術鑒定該突變體的遺傳揹景,確認該突變體的遺傳揹景與黃華佔一緻.文章利用改進的MutMap方法成功剋隆該雄性不育基因,突變位點與突變錶型的共分離分析錶明LOC_Os02g40450(MER3)是控製osms55突變體雄性不育的基因,該基因的剪切識彆位點髮生變異後導緻剪切異常,造成第5外顯子缺失15箇堿基,從而產生雄性不育.改進的MutMap方法無需精確組裝的野生型基因組序列作對照,而是通過將定位群體中有突變錶型植株的DNA pool和野生型植株DNA的重測序結果分彆與日本晴參攷基因組進行比對,然後再比較突變體和野生型的差異SNP來確定候選基因,該方法大大降低瞭野生型基因組測序和組裝成本,進一步擴大瞭MutMap方法的應用範圍.
통과대선도황화점EMS(갑광산을지)유변,사선득도일은성핵불육적수도웅성불육돌변체osms55,유전분석표명해돌변체위단기인공제적은성핵불육,채용고통량적Illumina Infinium iSelect SNP(50 K)심편검측기술감정해돌변체적유전배경,학인해돌변체적유전배경여황화점일치.문장이용개진적MutMap방법성공극륭해웅성불육기인,돌변위점여돌변표형적공분리분석표명LOC_Os02g40450(MER3)시공제osms55돌변체웅성불육적기인,해기인적전절식별위점발생변이후도치전절이상,조성제5외현자결실15개감기,종이산생웅성불육.개진적MutMap방법무수정학조장적야생형기인조서렬작대조,이시통과장정위군체중유돌변표형식주적DNA pool화야생형식주DNA적중측서결과분별여일본청삼고기인조진행비대,연후재비교돌변체화야생형적차이SNP래학정후선기인,해방법대대강저료야생형기인조측서화조장성본,진일보확대료MutMap방법적응용범위.
