遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2014年
1期
69-76
,共8页
miRNA%番茄%生物信息学%靶基因%启动子
miRNA%番茄%生物信息學%靶基因%啟動子
miRNA%번가%생물신식학%파기인%계동자
MicroRNAs(miRNAs)是一类在真核生物体内普遍存在的、长度约22nt的内源性非编码小分子RNA,它通过与靶mRNA的结合参与多种基因的表达调控.番茄作为一种重要的模式植物,其miRNA的研究近年来也取得了较大的进展.文章通过搜集已报道的文献和miRBase,找到番茄中34个miRNA的表达与致病相关,采用生物信息学方法预测它们的靶基因,利用Cytoscope软件构建miRNA及其靶基因的调控网络.从中筛选出13个与致病密切相关的miRNA,根据各miRNA之间关联性的大小及其与致病相关靶基因的多少,进一步选出miR169、miR482、miR5300、miR6024、miR6026和miR6027,并对其进行了靶基因功能分析、启动子分析及实时定量PCR验证,为全面深入研究miRNA的作用机制奠定了基础.
MicroRNAs(miRNAs)是一類在真覈生物體內普遍存在的、長度約22nt的內源性非編碼小分子RNA,它通過與靶mRNA的結閤參與多種基因的錶達調控.番茄作為一種重要的模式植物,其miRNA的研究近年來也取得瞭較大的進展.文章通過搜集已報道的文獻和miRBase,找到番茄中34箇miRNA的錶達與緻病相關,採用生物信息學方法預測它們的靶基因,利用Cytoscope軟件構建miRNA及其靶基因的調控網絡.從中篩選齣13箇與緻病密切相關的miRNA,根據各miRNA之間關聯性的大小及其與緻病相關靶基因的多少,進一步選齣miR169、miR482、miR5300、miR6024、miR6026和miR6027,併對其進行瞭靶基因功能分析、啟動子分析及實時定量PCR驗證,為全麵深入研究miRNA的作用機製奠定瞭基礎.
MicroRNAs(miRNAs)시일류재진핵생물체내보편존재적、장도약22nt적내원성비편마소분자RNA,타통과여파mRNA적결합삼여다충기인적표체조공.번가작위일충중요적모식식물,기miRNA적연구근년래야취득료교대적진전.문장통과수집이보도적문헌화miRBase,조도번가중34개miRNA적표체여치병상관,채용생물신식학방법예측타문적파기인,이용Cytoscope연건구건miRNA급기파기인적조공망락.종중사선출13개여치병밀절상관적miRNA,근거각miRNA지간관련성적대소급기여치병상관파기인적다소,진일보선출miR169、miR482、miR5300、miR6024、miR6026화miR6027,병대기진행료파기인공능분석、계동자분석급실시정량PCR험증,위전면심입연구miRNA적작용궤제전정료기출.
