遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2014年
1期
2-10
,共9页
宋庆峰%张红星%马亦龙%周钢桥
宋慶峰%張紅星%馬亦龍%週鋼橋
송경봉%장홍성%마역룡%주강교
全基因组关联研究%精细定位%遗传易感性%单核苷酸多态性
全基因組關聯研究%精細定位%遺傳易感性%單覈苷痠多態性
전기인조관련연구%정세정위%유전역감성%단핵감산다태성
以单核苷酸多态性(Single-nucleotide polymorphism,SNP)为遗传标记,采用全基因组关联研究(Genome-wide association studies,GWAS)的策略,已经在660多种疾病(或性状)中发现了3800多个遗传易感基因区域.但是,其中最显著关联的遗传变异或致病性的遗传变异位点及其生物学功能并不完全清楚.这些位点的鉴定有助于阐明复杂疾病的生物学机制,以及发现新的疾病标记物.后GWAS时代的主要任务之一就是通过精细定位研究找到复杂疾病易感基因区域内最显著关联的易感位点或致病性的易感位点并阐明其生物学功能.针对常见变异,可通过推断或重测序增加SNP密度,寻找最显著关联的SNP位点,并通过功能元件分析、表达数量性状位点(Expression quantitative trait locus,eQTL)分析和单体型分析等方法寻找功能性的SNP位点和易感基因.针对罕见变异,则可采用重测序、罕见单体型分析、家系分析和负荷检验等方法进行精细定位.文章对这些策略和所面临的问题进行了综述.
以單覈苷痠多態性(Single-nucleotide polymorphism,SNP)為遺傳標記,採用全基因組關聯研究(Genome-wide association studies,GWAS)的策略,已經在660多種疾病(或性狀)中髮現瞭3800多箇遺傳易感基因區域.但是,其中最顯著關聯的遺傳變異或緻病性的遺傳變異位點及其生物學功能併不完全清楚.這些位點的鑒定有助于闡明複雜疾病的生物學機製,以及髮現新的疾病標記物.後GWAS時代的主要任務之一就是通過精細定位研究找到複雜疾病易感基因區域內最顯著關聯的易感位點或緻病性的易感位點併闡明其生物學功能.針對常見變異,可通過推斷或重測序增加SNP密度,尋找最顯著關聯的SNP位點,併通過功能元件分析、錶達數量性狀位點(Expression quantitative trait locus,eQTL)分析和單體型分析等方法尋找功能性的SNP位點和易感基因.針對罕見變異,則可採用重測序、罕見單體型分析、傢繫分析和負荷檢驗等方法進行精細定位.文章對這些策略和所麵臨的問題進行瞭綜述.
이단핵감산다태성(Single-nucleotide polymorphism,SNP)위유전표기,채용전기인조관련연구(Genome-wide association studies,GWAS)적책략,이경재660다충질병(혹성상)중발현료3800다개유전역감기인구역.단시,기중최현저관련적유전변이혹치병성적유전변이위점급기생물학공능병불완전청초.저사위점적감정유조우천명복잡질병적생물학궤제,이급발현신적질병표기물.후GWAS시대적주요임무지일취시통과정세정위연구조도복잡질병역감기인구역내최현저관련적역감위점혹치병성적역감위점병천명기생물학공능.침대상견변이,가통과추단혹중측서증가SNP밀도,심조최현저관련적SNP위점,병통과공능원건분석、표체수량성상위점(Expression quantitative trait locus,eQTL)분석화단체형분석등방법심조공능성적SNP위점화역감기인.침대한견변이,칙가채용중측서、한견단체형분석、가계분석화부하검험등방법진행정세정위.문장대저사책략화소면림적문제진행료종술.
