中国油料作物学报
中國油料作物學報
중국유료작물학보
CHINESE JOURNAL OF OIL CROP SCIENCES
2014年
2期
181-188
,共8页
代梦媛%敖涛%徐伟%刘爱忠
代夢媛%敖濤%徐偉%劉愛忠
대몽원%오도%서위%류애충
蓖麻%DNA糖基化酶%脱甲基化%表观调控
蓖痳%DNA糖基化酶%脫甲基化%錶觀調控
비마%DNA당기화매%탈갑기화%표관조공
Ricinus communis%DNA glycosylase%Demethylation%Epigenetic regulation
为揭示DNA糖基化酶在调节蓖麻生长发育和影响基因印记过程中的分子机理,本研究基于蓖麻全基因组、利用生物信息学的方法结合转录组数据和RT-PCR半定量表达分析,鉴别蓖麻DNA糖基化酶氨基酸序列的结构特征、系统发生和表达形式.结果显示:三种DNA糖基化酶(DME、ROS和DML)氨基酸均为不稳定氨基酸,具有典型的与DNA结合和碱基切除修复有关的保守结构域;系统进化分析发现三种DNA糖基化酶在植物中同源性强,而且是独立演化的结果;在不同组织的表达上,蓖麻的DME和ROS基因具有相似的表达形式,即在根、茎和叶中不表达,在胚乳中表达最高,而DML在各个组织中都未检测到基因的表达.
為揭示DNA糖基化酶在調節蓖痳生長髮育和影響基因印記過程中的分子機理,本研究基于蓖痳全基因組、利用生物信息學的方法結閤轉錄組數據和RT-PCR半定量錶達分析,鑒彆蓖痳DNA糖基化酶氨基痠序列的結構特徵、繫統髮生和錶達形式.結果顯示:三種DNA糖基化酶(DME、ROS和DML)氨基痠均為不穩定氨基痠,具有典型的與DNA結閤和堿基切除脩複有關的保守結構域;繫統進化分析髮現三種DNA糖基化酶在植物中同源性彊,而且是獨立縯化的結果;在不同組織的錶達上,蓖痳的DME和ROS基因具有相似的錶達形式,即在根、莖和葉中不錶達,在胚乳中錶達最高,而DML在各箇組織中都未檢測到基因的錶達.
위게시DNA당기화매재조절비마생장발육화영향기인인기과정중적분자궤리,본연구기우비마전기인조、이용생물신식학적방법결합전록조수거화RT-PCR반정량표체분석,감별비마DNA당기화매안기산서렬적결구특정、계통발생화표체형식.결과현시:삼충DNA당기화매(DME、ROS화DML)안기산균위불은정안기산,구유전형적여DNA결합화감기절제수복유관적보수결구역;계통진화분석발현삼충DNA당기화매재식물중동원성강,이차시독립연화적결과;재불동조직적표체상,비마적DME화ROS기인구유상사적표체형식,즉재근、경화협중불표체,재배유중표체최고,이DML재각개조직중도미검측도기인적표체.
