中国油料作物学报
中國油料作物學報
중국유료작물학보
CHINESE JOURNAL OF OIL CROP SCIENCES
2014年
2期
160-167
,共8页
大豆%TPS家族基因%全基因组鉴定%进化分析%差异表达
大豆%TPS傢族基因%全基因組鑒定%進化分析%差異錶達
대두%TPS가족기인%전기인조감정%진화분석%차이표체
Glycine max%TPS family genes%Genome-wide identification%Phylogenetic analysis%Differential expression
利用大豆基因组数据库,通过生物信息学分析,鉴定并获得大豆TPS家族基因所有成员的全序列、基因结构和定位信息.利用序列比对对大豆TPS家族基因进行进化和分类分析,同时通过soybase大豆发育表达芯片数据库相关信息,对该家族基因成员的组织表达谱进行了检测.研究结果表明,大豆基因组中含有20个TPS家族基因成员.系统发育分析将这些TPS基因分成了两个亚家族.基因定位分析表明,这些成员基因分别分布于大豆的14条染色体上.启动子分析表明,全部大豆TPS家族基因的启动子区都含有逆境反应顺式作用元件.转录水平芯片数据分析同时显示,大豆TPS家族基因大多在花、根、根瘤等组织中存在优势表达.该研究结果将促进大豆TPS家族基因的功能研究与利用.
利用大豆基因組數據庫,通過生物信息學分析,鑒定併穫得大豆TPS傢族基因所有成員的全序列、基因結構和定位信息.利用序列比對對大豆TPS傢族基因進行進化和分類分析,同時通過soybase大豆髮育錶達芯片數據庫相關信息,對該傢族基因成員的組織錶達譜進行瞭檢測.研究結果錶明,大豆基因組中含有20箇TPS傢族基因成員.繫統髮育分析將這些TPS基因分成瞭兩箇亞傢族.基因定位分析錶明,這些成員基因分彆分佈于大豆的14條染色體上.啟動子分析錶明,全部大豆TPS傢族基因的啟動子區都含有逆境反應順式作用元件.轉錄水平芯片數據分析同時顯示,大豆TPS傢族基因大多在花、根、根瘤等組織中存在優勢錶達.該研究結果將促進大豆TPS傢族基因的功能研究與利用.
이용대두기인조수거고,통과생물신식학분석,감정병획득대두TPS가족기인소유성원적전서렬、기인결구화정위신식.이용서렬비대대대두TPS가족기인진행진화화분류분석,동시통과soybase대두발육표체심편수거고상관신식,대해가족기인성원적조직표체보진행료검측.연구결과표명,대두기인조중함유20개TPS가족기인성원.계통발육분석장저사TPS기인분성료량개아가족.기인정위분석표명,저사성원기인분별분포우대두적14조염색체상.계동자분석표명,전부대두TPS가족기인적계동자구도함유역경반응순식작용원건.전록수평심편수거분석동시현시,대두TPS가족기인대다재화、근、근류등조직중존재우세표체.해연구결과장촉진대두TPS가족기인적공능연구여이용.
