临床与实验病理学杂志
臨床與實驗病理學雜誌
림상여실험병이학잡지
CHINESE JOURNAL OF CLINICAL AND EXPERIMENTAL PATHOLOGY
2013年
3期
301-305
,共5页
朱萌%张宁%任牡丹%卢新兰%和水祥
硃萌%張寧%任牡丹%盧新蘭%和水祥
주맹%장저%임모단%로신란%화수상
福尔马林固定-石蜡包埋%RNA抽提%方法
福爾馬林固定-石蠟包埋%RNA抽提%方法
복이마림고정-석사포매%RNA추제%방법
目的 探讨从福尔马林固定-石蜡包埋(formalin-fixed paraffin-embedded,FFPE)组织中抽提RNA的可行性和有效性.方法 收集胃癌和癌旁FFPE样本各41例,10 μm厚连续切片3张,采用蛋白酶消化盐析法抽提纯化RNA,检测提取RNA的产量和质量并分析其应用价值.结果 41对胃癌和癌旁FFPE样本中抽提的RNA纯度为1.578 ~3.175,平均2.022 ±0.190,其中癌组织为1.578 ~3.175,平均2.033±0.240,癌旁组织为1.726 ~2.329,平均2.011±0.123;RNA浓度为(26.8 ~1 087) ng/μl,平均(267.062±210.435) ng/μl,其中癌组织为(50.5 ~1 087) ng/μl,平均(336.5±228.927) ng/μl,癌旁组织为(26.8~820) ng/μl,平均(197.62±165.47) ng/μl;琼脂糖凝胶电泳条带弥散分布,约300bp;胃癌和癌旁RNA的纯度比较P=0.564,尚不能认为胃癌和癌旁FFPE样本中抽提的RNA纯度有不同,但浓度比较P=0.001,可认为胃癌和癌旁FFPE样本中抽提的RNA浓度有所不同,癌组织中较高.结论 从FFPE样本中抽提的RNA在不可避免地出现降解的情况下仍然具有很高的纯度和合适的浓度;在确保扩增产物大小处于一定范围内的前提下从FFPE样本中抽提的RNA具有可以满足下游应用的纯度、浓度和完整性;建立从FFPE样本中抽提RNA的方法在各种影响因素符合要求后完全可行.
目的 探討從福爾馬林固定-石蠟包埋(formalin-fixed paraffin-embedded,FFPE)組織中抽提RNA的可行性和有效性.方法 收集胃癌和癌徬FFPE樣本各41例,10 μm厚連續切片3張,採用蛋白酶消化鹽析法抽提純化RNA,檢測提取RNA的產量和質量併分析其應用價值.結果 41對胃癌和癌徬FFPE樣本中抽提的RNA純度為1.578 ~3.175,平均2.022 ±0.190,其中癌組織為1.578 ~3.175,平均2.033±0.240,癌徬組織為1.726 ~2.329,平均2.011±0.123;RNA濃度為(26.8 ~1 087) ng/μl,平均(267.062±210.435) ng/μl,其中癌組織為(50.5 ~1 087) ng/μl,平均(336.5±228.927) ng/μl,癌徬組織為(26.8~820) ng/μl,平均(197.62±165.47) ng/μl;瓊脂糖凝膠電泳條帶瀰散分佈,約300bp;胃癌和癌徬RNA的純度比較P=0.564,尚不能認為胃癌和癌徬FFPE樣本中抽提的RNA純度有不同,但濃度比較P=0.001,可認為胃癌和癌徬FFPE樣本中抽提的RNA濃度有所不同,癌組織中較高.結論 從FFPE樣本中抽提的RNA在不可避免地齣現降解的情況下仍然具有很高的純度和閤適的濃度;在確保擴增產物大小處于一定範圍內的前提下從FFPE樣本中抽提的RNA具有可以滿足下遊應用的純度、濃度和完整性;建立從FFPE樣本中抽提RNA的方法在各種影響因素符閤要求後完全可行.
목적 탐토종복이마림고정-석사포매(formalin-fixed paraffin-embedded,FFPE)조직중추제RNA적가행성화유효성.방법 수집위암화암방FFPE양본각41례,10 μm후련속절편3장,채용단백매소화염석법추제순화RNA,검측제취RNA적산량화질량병분석기응용개치.결과 41대위암화암방FFPE양본중추제적RNA순도위1.578 ~3.175,평균2.022 ±0.190,기중암조직위1.578 ~3.175,평균2.033±0.240,암방조직위1.726 ~2.329,평균2.011±0.123;RNA농도위(26.8 ~1 087) ng/μl,평균(267.062±210.435) ng/μl,기중암조직위(50.5 ~1 087) ng/μl,평균(336.5±228.927) ng/μl,암방조직위(26.8~820) ng/μl,평균(197.62±165.47) ng/μl;경지당응효전영조대미산분포,약300bp;위암화암방RNA적순도비교P=0.564,상불능인위위암화암방FFPE양본중추제적RNA순도유불동,단농도비교P=0.001,가인위위암화암방FFPE양본중추제적RNA농도유소불동,암조직중교고.결론 종FFPE양본중추제적RNA재불가피면지출현강해적정황하잉연구유흔고적순도화합괄적농도;재학보확증산물대소처우일정범위내적전제하종FFPE양본중추제적RNA구유가이만족하유응용적순도、농도화완정성;건립종FFPE양본중추제RNA적방법재각충영향인소부합요구후완전가행.