基因组学与应用生物学
基因組學與應用生物學
기인조학여응용생물학
GENOMICS AND APPLIED BIOLOGY
2013年
4期
526-532
,共7页
黄夕洋%唐辉%孔德鑫%王满莲%史艳财%邹蓉
黃夕洋%唐輝%孔德鑫%王滿蓮%史豔財%鄒蓉
황석양%당휘%공덕흠%왕만련%사염재%추용
广西甜茶%ISSR%PCR反应条件%单因素优化
廣西甜茶%ISSR%PCR反應條件%單因素優化
엄서첨다%ISSR%PCR반응조건%단인소우화
Rubus suavissimus S. Lee%ISSR%PCR reaction conditions%Single factor experiment
为了探讨广西甜茶ISSR实验中的多种因素对实验结果的影响,采用单因素法对PCR反应体系中的5个潜在因素(Mg2+, dNTP,引物, Taq酶和模板DNA)在5水平上进行优化实验,并进一步优化了反应程序中的退火温度和循环次数。结果表明:25滋L的最佳反应体系为,1×PCR Buffer、MgCl22.0 mmol/L、dNTP 0.2 mmol/L、引物0.8滋mol/L、Taq DNA聚合酶0.75 U、模板DNA 80 ng;最佳反应程序为:在94℃下进行3 min预变性;随后循环扩增35次(包括94℃变性1 min,54℃退火1 min,72℃延伸1 min);最后在72℃下延伸10 min。本研究建立的广西甜茶的最佳ISSR-PCR反应条件为进一步进行遗传多样性研究奠定了基础。
為瞭探討廣西甜茶ISSR實驗中的多種因素對實驗結果的影響,採用單因素法對PCR反應體繫中的5箇潛在因素(Mg2+, dNTP,引物, Taq酶和模闆DNA)在5水平上進行優化實驗,併進一步優化瞭反應程序中的退火溫度和循環次數。結果錶明:25滋L的最佳反應體繫為,1×PCR Buffer、MgCl22.0 mmol/L、dNTP 0.2 mmol/L、引物0.8滋mol/L、Taq DNA聚閤酶0.75 U、模闆DNA 80 ng;最佳反應程序為:在94℃下進行3 min預變性;隨後循環擴增35次(包括94℃變性1 min,54℃退火1 min,72℃延伸1 min);最後在72℃下延伸10 min。本研究建立的廣西甜茶的最佳ISSR-PCR反應條件為進一步進行遺傳多樣性研究奠定瞭基礎。
위료탐토엄서첨다ISSR실험중적다충인소대실험결과적영향,채용단인소법대PCR반응체계중적5개잠재인소(Mg2+, dNTP,인물, Taq매화모판DNA)재5수평상진행우화실험,병진일보우화료반응정서중적퇴화온도화순배차수。결과표명:25자L적최가반응체계위,1×PCR Buffer、MgCl22.0 mmol/L、dNTP 0.2 mmol/L、인물0.8자mol/L、Taq DNA취합매0.75 U、모판DNA 80 ng;최가반응정서위:재94℃하진행3 min예변성;수후순배확증35차(포괄94℃변성1 min,54℃퇴화1 min,72℃연신1 min);최후재72℃하연신10 min。본연구건립적엄서첨다적최가ISSR-PCR반응조건위진일보진행유전다양성연구전정료기출。
In order to study the influence of several potential factors on ISSR system for Rubus suavissimus S. Lee., five factors (Mg2+, dNTP, primer, Taq DNA polymerase and DNA template) were optimized by multiple single factor experiments at 5 concentration levels, annealing temperatures and amplification cycle numbers were also optimized. The results showed that the optimum 25μL reaction system comprises 1íPCR buffer, MgCl2 2.0 mmol/L, dNTP 0.2 mmol/L, primer 0.8μmol/L, Taq DNA polymerase 0.75 U and template DNA 80 ng;and the optimum PCR procedure is as an initial pre-denaturing at 94℃for 3 min, which precedes 35 cycles of denaturing at 94℃for 1 min, annealing at 54℃ for 1 min, and extension at 72℃ for 1 min, with a final extension at 72℃ for 10 min. Establish-ment of the optimum ISSR-PCR systems and conditions would serve as a base for further study on the genetic diver-sity of Rubus suavissimus S. Lee.