计算机与应用化学
計算機與應用化學
계산궤여응용화학
COMPUTERS AND APPLIED CHEMISTRY
2012年
6期
639-641
,共3页
肝素%孕激素受体%分子对接
肝素%孕激素受體%分子對接
간소%잉격소수체%분자대접
heparin%progesterone receptor%molecular docking method
用分子对接模拟软件研究了肝素与孕激素受体的相互作用.以肝素中的一糖单位作为探针对孕激素受体蛋白进行搜索,获得肝素组成单位与孕激素受体的特异性结合模式.结果发现,2-O-硫酸-a-L艾杜糖醛酸(2-O-sulfated iduronic acid,IdoA(2S)作为肝素的核心组成单糖之一,与孕激素受体的结合能力最好.分子对接结果显示IdoA(2S)深入到孕激素受体的helix2和helix 11所包围的结合口袋,与孕激素受体结合结构域关键残基Asn 719形成稳固的氢键；并与孕激素受体结合结构域的关键残基Met 909残基侧链近距离接触,揭示了IdoA(2S)可能具有的孕激素受体拮抗效应的分子作用机制.本模拟实验所建立的模型能够部分解释肝素抑制孕激素依赖性乳腺癌的现象,同时推测了其相应机理.
用分子對接模擬軟件研究瞭肝素與孕激素受體的相互作用.以肝素中的一糖單位作為探針對孕激素受體蛋白進行搜索,穫得肝素組成單位與孕激素受體的特異性結閤模式.結果髮現,2-O-硫痠-a-L艾杜糖醛痠(2-O-sulfated iduronic acid,IdoA(2S)作為肝素的覈心組成單糖之一,與孕激素受體的結閤能力最好.分子對接結果顯示IdoA(2S)深入到孕激素受體的helix2和helix 11所包圍的結閤口袋,與孕激素受體結閤結構域關鍵殘基Asn 719形成穩固的氫鍵；併與孕激素受體結閤結構域的關鍵殘基Met 909殘基側鏈近距離接觸,揭示瞭IdoA(2S)可能具有的孕激素受體拮抗效應的分子作用機製.本模擬實驗所建立的模型能夠部分解釋肝素抑製孕激素依賴性乳腺癌的現象,同時推測瞭其相應機理.
용분자대접모의연건연구료간소여잉격소수체적상호작용.이간소중적일당단위작위탐침대잉격소수체단백진행수색,획득간소조성단위여잉격소수체적특이성결합모식.결과발현,2-O-류산-a-L애두당철산(2-O-sulfated iduronic acid,IdoA(2S)작위간소적핵심조성단당지일,여잉격소수체적결합능력최호.분자대접결과현시IdoA(2S)심입도잉격소수체적helix2화helix 11소포위적결합구대,여잉격소수체결합결구역관건잔기Asn 719형성은고적경건；병여잉격소수체결합결구역적관건잔기Met 909잔기측련근거리접촉,게시료IdoA(2S)가능구유적잉격소수체길항효응적분자작용궤제.본모의실험소건립적모형능구부분해석간소억제잉격소의뢰성유선암적현상,동시추측료기상응궤리.
