计算机与应用化学
計算機與應用化學
계산궤여응용화학
COMPUTERS AND APPLIED CHEMISTRY
2012年
8期
943-946
,共4页
欧式距离%靶点识别%药物筛选
歐式距離%靶點識彆%藥物篩選
구식거리%파점식별%약물사선
针对新化合物作用靶点的大规模识别问题,提出基于欧式距离的化合物作用靶点识别方法.本方法以作用于同一靶点的药物分子结构为基础,计算其分子结构描述符,并以结构描述符为基础计算药物两两之间的欧式距离,利用置信区间估计的方法估算作用于该靶点化合物间的距离上限.若新化合物与上述各药物分子之间的距离小于估算的距离上限,则判断新化合物作用于该靶点.利用已知作用关系的177个靶点、767个化合物的数据对所建立的方法进行检验,判断总正确率为70.66%,对于有活性的化合物判断正确率达到82.20%,结果证明该方法可以用于对新化合物生物活性的大规模识别,对设计活性筛选实验具有参考价值.
針對新化閤物作用靶點的大規模識彆問題,提齣基于歐式距離的化閤物作用靶點識彆方法.本方法以作用于同一靶點的藥物分子結構為基礎,計算其分子結構描述符,併以結構描述符為基礎計算藥物兩兩之間的歐式距離,利用置信區間估計的方法估算作用于該靶點化閤物間的距離上限.若新化閤物與上述各藥物分子之間的距離小于估算的距離上限,則判斷新化閤物作用于該靶點.利用已知作用關繫的177箇靶點、767箇化閤物的數據對所建立的方法進行檢驗,判斷總正確率為70.66%,對于有活性的化閤物判斷正確率達到82.20%,結果證明該方法可以用于對新化閤物生物活性的大規模識彆,對設計活性篩選實驗具有參攷價值.
침대신화합물작용파점적대규모식별문제,제출기우구식거리적화합물작용파점식별방법.본방법이작용우동일파점적약물분자결구위기출,계산기분자결구묘술부,병이결구묘술부위기출계산약물량량지간적구식거리,이용치신구간고계적방법고산작용우해파점화합물간적거리상한.약신화합물여상술각약물분자지간적거리소우고산적거리상한,칙판단신화합물작용우해파점.이용이지작용관계적177개파점、767개화합물적수거대소건립적방법진행검험,판단총정학솔위70.66%,대우유활성적화합물판단정학솔체도82.20%,결과증명해방법가이용우대신화합물생물활성적대규모식별,대설계활성사선실험구유삼고개치.