中国农学通报
中國農學通報
중국농학통보
CHINESE AGRICULTURAL SCIENCE BULLETIN
2012年
34期
85-91
,共7页
古丽吉米拉·米吉提%范海娟%刘志华%王娜%窦恺%黄颖%王志英
古麗吉米拉·米吉提%範海娟%劉誌華%王娜%竇愷%黃穎%王誌英
고려길미랍·미길제%범해연%류지화%왕나%두개%황영%왕지영
棘孢木霉%小分子疏水蛋白%基因克隆%生物信息学%序列分析
棘孢木黴%小分子疏水蛋白%基因剋隆%生物信息學%序列分析
극포목매%소분자소수단백%기인극륭%생물신식학%서렬분석
为了深入研究生物防治菌棘孢木霉T4菌株小分子疏水蛋白hyb2的功能,基于已知小分子疏水蛋白基因hyb2部分cDNA序列设计引物,分别以棘孢木霉T4菌株菌丝体总mRNA和基因组DNA为模板,进行PCR扩增,克隆获得hyb2的全长cDNA和DNA序列,其GenBank接受号分别为JX014433和JX185070,cDNA序列编码区长度为321 bp,编码106个氨基酸.BlastP相似性分析表明该基因与深绿木霉的Tahyd5a(ABS59366)基因同源性最高为87％,SignalP信号肽分析表明N端第16和17个氨基酸中间有一个信号肽剪切位点(AFA||AP).Pfam蛋白家族分析表明它属于hydrophobin_2 superfamily家族.将棘孢木霉T4菌株小分子疏水蛋白基因hyb2对深绿木霉ATCC74058基因组和绿色木霉Gv29-8基因组进行同源性搜索,在2个近缘种的基因组上分别获得9个和8个同源序列.其中,深绿木霉ATCC74058的hyb-a-7和绿色木霉Gv29-8的hyb-v-5疏水蛋白与棘孢木霉hyb2相似性最高分别为87％和70％,2个序列分别位于深绿木霉ATCC74058染色体骨架5和绿色木霉Gv29-8染色体骨架22上.
為瞭深入研究生物防治菌棘孢木黴T4菌株小分子疏水蛋白hyb2的功能,基于已知小分子疏水蛋白基因hyb2部分cDNA序列設計引物,分彆以棘孢木黴T4菌株菌絲體總mRNA和基因組DNA為模闆,進行PCR擴增,剋隆穫得hyb2的全長cDNA和DNA序列,其GenBank接受號分彆為JX014433和JX185070,cDNA序列編碼區長度為321 bp,編碼106箇氨基痠.BlastP相似性分析錶明該基因與深綠木黴的Tahyd5a(ABS59366)基因同源性最高為87％,SignalP信號肽分析錶明N耑第16和17箇氨基痠中間有一箇信號肽剪切位點(AFA||AP).Pfam蛋白傢族分析錶明它屬于hydrophobin_2 superfamily傢族.將棘孢木黴T4菌株小分子疏水蛋白基因hyb2對深綠木黴ATCC74058基因組和綠色木黴Gv29-8基因組進行同源性搜索,在2箇近緣種的基因組上分彆穫得9箇和8箇同源序列.其中,深綠木黴ATCC74058的hyb-a-7和綠色木黴Gv29-8的hyb-v-5疏水蛋白與棘孢木黴hyb2相似性最高分彆為87％和70％,2箇序列分彆位于深綠木黴ATCC74058染色體骨架5和綠色木黴Gv29-8染色體骨架22上.
위료심입연구생물방치균극포목매T4균주소분자소수단백hyb2적공능,기우이지소분자소수단백기인hyb2부분cDNA서렬설계인물,분별이극포목매T4균주균사체총mRNA화기인조DNA위모판,진행PCR확증,극륭획득hyb2적전장cDNA화DNA서렬,기GenBank접수호분별위JX014433화JX185070,cDNA서렬편마구장도위321 bp,편마106개안기산.BlastP상사성분석표명해기인여심록목매적Tahyd5a(ABS59366)기인동원성최고위87％,SignalP신호태분석표명N단제16화17개안기산중간유일개신호태전절위점(AFA||AP).Pfam단백가족분석표명타속우hydrophobin_2 superfamily가족.장극포목매T4균주소분자소수단백기인hyb2대심록목매ATCC74058기인조화록색목매Gv29-8기인조진행동원성수색,재2개근연충적기인조상분별획득9개화8개동원서렬.기중,심록목매ATCC74058적hyb-a-7화록색목매Gv29-8적hyb-v-5소수단백여극포목매hyb2상사성최고분별위87％화70％,2개서렬분별위우심록목매ATCC74058염색체골가5화록색목매Gv29-8염색체골가22상.
