江苏农业科学
江囌農業科學
강소농업과학
JIANGSU AGRICULTURAL SCIENCES
2014年
5期
42-45
,共4页
陶隽%贾青%魏星灿%胡慧艳%邢增喜
陶雋%賈青%魏星燦%鬍慧豔%邢增喜
도준%가청%위성찬%호혜염%형증희
猪%ACACA基因%蛋白质%生物信息学
豬%ACACA基因%蛋白質%生物信息學
저%ACACA기인%단백질%생물신식학
为从分子水平研究猪脂肪合成过程,对脂肪合成关键酶乙酰辅酶A羧化酶-α基因( ACACA)进行分析。采用生物信息学的方法,查找猪ACACA基因的ORF框,对基因CDS序列的限制性酶切位点进行分析,并对其编码蛋白质的理化性质、二级结构、三级结构、拓扑结构、结构功能域进行预测分析。结果表明,猪ACACA基因 CDS区全长7041 bp,其编码蛋白质含2346个氨基酸。二级结构以α螺旋与无规则卷曲为主,局部出现β转角,三级结构显示结果与二级结构预测结果相符。该蛋白质为亲水性蛋白质,N端无信号肽,为非分泌蛋白质;不含跨膜结构区,未定位于膜内,预测其为膜外区蛋白质;亚细胞定位结果显示该蛋白质为非细胞器蛋白质,是胞质蛋白质的可能性最大;功能域分析发现该蛋白质序列含有BC结构域、CT结构域、CPSase 大亚基N端结构域、ATP-grasp折叠结构域、生物素基/硫辛酰基结合域等及一些蛋白质基序。该结果将为进一步研究猪ACACA基因与脂肪合成的关系提供基础资料。
為從分子水平研究豬脂肪閤成過程,對脂肪閤成關鍵酶乙酰輔酶A羧化酶-α基因( ACACA)進行分析。採用生物信息學的方法,查找豬ACACA基因的ORF框,對基因CDS序列的限製性酶切位點進行分析,併對其編碼蛋白質的理化性質、二級結構、三級結構、拓撲結構、結構功能域進行預測分析。結果錶明,豬ACACA基因 CDS區全長7041 bp,其編碼蛋白質含2346箇氨基痠。二級結構以α螺鏇與無規則捲麯為主,跼部齣現β轉角,三級結構顯示結果與二級結構預測結果相符。該蛋白質為親水性蛋白質,N耑無信號肽,為非分泌蛋白質;不含跨膜結構區,未定位于膜內,預測其為膜外區蛋白質;亞細胞定位結果顯示該蛋白質為非細胞器蛋白質,是胞質蛋白質的可能性最大;功能域分析髮現該蛋白質序列含有BC結構域、CT結構域、CPSase 大亞基N耑結構域、ATP-grasp摺疊結構域、生物素基/硫辛酰基結閤域等及一些蛋白質基序。該結果將為進一步研究豬ACACA基因與脂肪閤成的關繫提供基礎資料。
위종분자수평연구저지방합성과정,대지방합성관건매을선보매A최화매-α기인( ACACA)진행분석。채용생물신식학적방법,사조저ACACA기인적ORF광,대기인CDS서렬적한제성매절위점진행분석,병대기편마단백질적이화성질、이급결구、삼급결구、탁복결구、결구공능역진행예측분석。결과표명,저ACACA기인 CDS구전장7041 bp,기편마단백질함2346개안기산。이급결구이α라선여무규칙권곡위주,국부출현β전각,삼급결구현시결과여이급결구예측결과상부。해단백질위친수성단백질,N단무신호태,위비분비단백질;불함과막결구구,미정위우막내,예측기위막외구단백질;아세포정위결과현시해단백질위비세포기단백질,시포질단백질적가능성최대;공능역분석발현해단백질서렬함유BC결구역、CT결구역、CPSase 대아기N단결구역、ATP-grasp절첩결구역、생물소기/류신선기결합역등급일사단백질기서。해결과장위진일보연구저ACACA기인여지방합성적관계제공기출자료。