江苏农业科学
江囌農業科學
강소농업과학
JIANGSU AGRICULTURAL SCIENCES
2014年
5期
23-29
,共7页
水稻%脂肪酶%生物信息学%氨基酸序列
水稻%脂肪酶%生物信息學%氨基痠序列
수도%지방매%생물신식학%안기산서렬
利用NCBI数据库及电子克隆技术克隆了水稻 PLA-I｛gamma｝1类似基因，命名为OsPLA-I｛gamma｝1。序列分析表明，其开放阅读框为1374 bp，只含有1个外显子，没有内含子。利用生物信息学软件对OsPLA-I｛gamma｝1蛋白的理化性质、疏水性/亲水性、跨膜区、亚细胞定位、蛋白质结构及功能等进行预测分析。结果表明：该蛋白分子式为C2138 H3409 N625 O637 S19，氨基酸总数为457个，分子量为48670．5，理论等电点为pI 8．86，为亲水性稳定蛋白；α螺旋和不规则卷曲是其蛋白质二级结构的主要构件，延伸链散布于整个蛋白质中；属于脂肪酶，活性受可逆磷酸化或糖基化作用调控，具有能量代谢功能，是水稻的生长因子；定位于叶绿体基质腔中；含有19个蛋白激酶磷酸化位点，“Ser”磷酸化位点11个，“Thr”磷酸化位点5个，“Tyr”磷酸化位点3个；含有17个“O-β-GlcNAc”位点，丝氨酸5个，苏氨酸12个；与粗山羊草、蒺藜苜蓿、甘蓝型油菜、拟南芥的脂肪酶有较高的同源性。本研究结果为进一步研究该基因的功能和作用机制奠定基础。
利用NCBI數據庫及電子剋隆技術剋隆瞭水稻 PLA-I｛gamma｝1類似基因，命名為OsPLA-I｛gamma｝1。序列分析錶明，其開放閱讀框為1374 bp，隻含有1箇外顯子，沒有內含子。利用生物信息學軟件對OsPLA-I｛gamma｝1蛋白的理化性質、疏水性/親水性、跨膜區、亞細胞定位、蛋白質結構及功能等進行預測分析。結果錶明：該蛋白分子式為C2138 H3409 N625 O637 S19，氨基痠總數為457箇，分子量為48670．5，理論等電點為pI 8．86，為親水性穩定蛋白；α螺鏇和不規則捲麯是其蛋白質二級結構的主要構件，延伸鏈散佈于整箇蛋白質中；屬于脂肪酶，活性受可逆燐痠化或糖基化作用調控，具有能量代謝功能，是水稻的生長因子；定位于葉綠體基質腔中；含有19箇蛋白激酶燐痠化位點，“Ser”燐痠化位點11箇，“Thr”燐痠化位點5箇，“Tyr”燐痠化位點3箇；含有17箇“O-β-GlcNAc”位點，絲氨痠5箇，囌氨痠12箇；與粗山羊草、蒺藜苜蓿、甘藍型油菜、擬南芥的脂肪酶有較高的同源性。本研究結果為進一步研究該基因的功能和作用機製奠定基礎。
이용NCBI수거고급전자극륭기술극륭료수도 PLA-I｛gamma｝1유사기인，명명위OsPLA-I｛gamma｝1。서렬분석표명，기개방열독광위1374 bp，지함유1개외현자，몰유내함자。이용생물신식학연건대OsPLA-I｛gamma｝1단백적이화성질、소수성/친수성、과막구、아세포정위、단백질결구급공능등진행예측분석。결과표명：해단백분자식위C2138 H3409 N625 O637 S19，안기산총수위457개，분자량위48670．5，이론등전점위pI 8．86，위친수성은정단백；α라선화불규칙권곡시기단백질이급결구적주요구건，연신련산포우정개단백질중；속우지방매，활성수가역린산화혹당기화작용조공，구유능량대사공능，시수도적생장인자；정위우협록체기질강중；함유19개단백격매린산화위점，“Ser”린산화위점11개，“Thr”린산화위점5개，“Tyr”린산화위점3개；함유17개“O-β-GlcNAc”위점，사안산5개，소안산12개；여조산양초、질려목숙、감람형유채、의남개적지방매유교고적동원성。본연구결과위진일보연구해기인적공능화작용궤제전정기출。
