河南农业大学学报
河南農業大學學報
하남농업대학학보
ACTA AGRICULTURAE UNIVERSITATIS HENANENSIS
2013年
1期
61-67
,共7页
张建宏%张淑平%陈文%康相涛%黄艳群
張建宏%張淑平%陳文%康相濤%黃豔群
장건굉%장숙평%진문%강상도%황염군
鸡%Lpin1基因%微卫星变异%转录因子结合位点
鷄%Lpin1基因%微衛星變異%轉錄因子結閤位點
계%Lpin1기인%미위성변이%전록인자결합위점
为了掌握鸡Lpin1基因组内微卫星的分布特性,采用SSR hunter软件搜索位于鸡Lpin1基因组序列内的微卫星序列,并采用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳结合克隆测序的方法对位于预测的启动子区域的复合微卫星进行了研究.结果表明,从鸡Lpin1基因组内搜索到9个微卫星,其分布频率为每5.5 kb1个微卫星;对位于鸡Lpin1基因的5’侧翼区(预测的启动子区域附近)的复合微卫星(命名为CLP532)进行多态性研究,共检测到7个等位基因,其序列长度变异在25 bp.从6个鸡品种(固始鸡、河南斗鸡、卢氏鸡、白洛克、来航鸡、丝毛乌骨鸡)中检测到CLP532微卫星的6种等位基因.TFSEARCH软件预测CLP532微卫星长度的变异可引起鸡Lpin1基因转录因子结合位点的改变.研究结果显示,鸡Lpin1基因组内存在丰富的微卫星,CLP532微卫星具有丰富的多态,CLP532微卫星长度变异对鸡Lpin1基因的表达调控具有潜在重要的作用.
為瞭掌握鷄Lpin1基因組內微衛星的分佈特性,採用SSR hunter軟件搜索位于鷄Lpin1基因組序列內的微衛星序列,併採用非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳結閤剋隆測序的方法對位于預測的啟動子區域的複閤微衛星進行瞭研究.結果錶明,從鷄Lpin1基因組內搜索到9箇微衛星,其分佈頻率為每5.5 kb1箇微衛星;對位于鷄Lpin1基因的5’側翼區(預測的啟動子區域附近)的複閤微衛星(命名為CLP532)進行多態性研究,共檢測到7箇等位基因,其序列長度變異在25 bp.從6箇鷄品種(固始鷄、河南鬥鷄、盧氏鷄、白洛剋、來航鷄、絲毛烏骨鷄)中檢測到CLP532微衛星的6種等位基因.TFSEARCH軟件預測CLP532微衛星長度的變異可引起鷄Lpin1基因轉錄因子結閤位點的改變.研究結果顯示,鷄Lpin1基因組內存在豐富的微衛星,CLP532微衛星具有豐富的多態,CLP532微衛星長度變異對鷄Lpin1基因的錶達調控具有潛在重要的作用.
위료장악계Lpin1기인조내미위성적분포특성,채용SSR hunter연건수색위우계Lpin1기인조서렬내적미위성서렬,병채용비변성취병희선알응효전영결합극륭측서적방법대위우예측적계동자구역적복합미위성진행료연구.결과표명,종계Lpin1기인조내수색도9개미위성,기분포빈솔위매5.5 kb1개미위성;대위우계Lpin1기인적5’측익구(예측적계동자구역부근)적복합미위성(명명위CLP532)진행다태성연구,공검측도7개등위기인,기서렬장도변이재25 bp.종6개계품충(고시계、하남두계、로씨계、백락극、래항계、사모오골계)중검측도CLP532미위성적6충등위기인.TFSEARCH연건예측CLP532미위성장도적변이가인기계Lpin1기인전록인자결합위점적개변.연구결과현시,계Lpin1기인조내존재봉부적미위성,CLP532미위성구유봉부적다태,CLP532미위성장도변이대계Lpin1기인적표체조공구유잠재중요적작용.