山地农业生物学报
山地農業生物學報
산지농업생물학보
JOURNAL OF MOUNTAIN AGRICULTURE AND BIOLOGY
2013年
2期
114-118
,共5页
袁恬%冉雪琴%王芳%陈颖%王嘉福%张兆强
袁恬%冉雪琴%王芳%陳穎%王嘉福%張兆彊
원념%염설금%왕방%진영%왕가복%장조강
香猪%Myf5%基因克隆%序列分析
香豬%Myf5%基因剋隆%序列分析
향저%Myf5%기인극륭%서렬분석
为明确猪Myf5基因的蛋白结构及功能位点,从香猪、大白猪和大白×长白杂交猪背最长肌提取总RNA,采用RT-PCR技术克隆Myf5基因,其cDNA长893 bp,包括完整的开放阅读框768 bp,编码255个氨基酸.将所测序列与GenBank上已知猪种序列进行相似性比较,结果表明:香猪Myf5基因中有3个碱基变异,其中2个突变不改变编码的氨基酸为无义突变,1个突变使其编码的氨基酸由甲硫氨酸(M)变为亮氨酸(L).大白猪没有碱基变化；大白×长白杂交猪Myf5基因中的1个突变,使其编码氨基酸由甘氨酸(E)变为谷氨酸(G).将香猪与其他物种进行核苷酸和氨基酸编码区序列的相似性分析及生物信息学分析.相似性分析表明,香猪Myf5基因氨基酸编码区序列与绵羊、牛、马、兔、黑猩猩、非洲象和小鼠的相似性较高,均在88％以上,推测Myf5基因在哺乳动物具有一定的保守性；Myf5蛋白二级结构以无规则卷曲为主,其次为α螺旋,偶有β转角.预测Myf5蛋白不舍信号肽序列,有29个磷酸化位点.
為明確豬Myf5基因的蛋白結構及功能位點,從香豬、大白豬和大白×長白雜交豬揹最長肌提取總RNA,採用RT-PCR技術剋隆Myf5基因,其cDNA長893 bp,包括完整的開放閱讀框768 bp,編碼255箇氨基痠.將所測序列與GenBank上已知豬種序列進行相似性比較,結果錶明:香豬Myf5基因中有3箇堿基變異,其中2箇突變不改變編碼的氨基痠為無義突變,1箇突變使其編碼的氨基痠由甲硫氨痠(M)變為亮氨痠(L).大白豬沒有堿基變化；大白×長白雜交豬Myf5基因中的1箇突變,使其編碼氨基痠由甘氨痠(E)變為穀氨痠(G).將香豬與其他物種進行覈苷痠和氨基痠編碼區序列的相似性分析及生物信息學分析.相似性分析錶明,香豬Myf5基因氨基痠編碼區序列與綿羊、牛、馬、兔、黑猩猩、非洲象和小鼠的相似性較高,均在88％以上,推測Myf5基因在哺乳動物具有一定的保守性；Myf5蛋白二級結構以無規則捲麯為主,其次為α螺鏇,偶有β轉角.預測Myf5蛋白不捨信號肽序列,有29箇燐痠化位點.
위명학저Myf5기인적단백결구급공능위점,종향저、대백저화대백×장백잡교저배최장기제취총RNA,채용RT-PCR기술극륭Myf5기인,기cDNA장893 bp,포괄완정적개방열독광768 bp,편마255개안기산.장소측서렬여GenBank상이지저충서렬진행상사성비교,결과표명:향저Myf5기인중유3개감기변이,기중2개돌변불개변편마적안기산위무의돌변,1개돌변사기편마적안기산유갑류안산(M)변위량안산(L).대백저몰유감기변화；대백×장백잡교저Myf5기인중적1개돌변,사기편마안기산유감안산(E)변위곡안산(G).장향저여기타물충진행핵감산화안기산편마구서렬적상사성분석급생물신식학분석.상사성분석표명,향저Myf5기인안기산편마구서렬여면양、우、마、토、흑성성、비주상화소서적상사성교고,균재88％이상,추측Myf5기인재포유동물구유일정적보수성；Myf5단백이급결구이무규칙권곡위주,기차위α라선,우유β전각.예측Myf5단백불사신호태서렬,유29개린산화위점.
