南方农业学报
南方農業學報
남방농업학보
GUANGXI AGRICULTURAL SCIENCES
2013年
3期
501-506
,共6页
王晶%彭广南%蒋钦杨%陈宝剑%郭亚芬%兰干球%蒋和生
王晶%彭廣南%蔣欽楊%陳寶劍%郭亞芬%蘭榦毬%蔣和生
왕정%팽엄남%장흠양%진보검%곽아분%란간구%장화생
三黄鸡%脂蛋白脂酶基因%克隆%碱基突变%蛋白质二级构象%广西
三黃鷄%脂蛋白脂酶基因%剋隆%堿基突變%蛋白質二級構象%廣西
삼황계%지단백지매기인%극륭%감기돌변%단백질이급구상%엄서
[目的]对广西三黄鸡和爱拔益加(AA)鸡的脂蛋白脂酶基因(LPL)进行克隆与蛋白质结构分析,为后期开展LPL基因表达与鸡肌内脂肪含量相关性研究及筛选出与优质肉质相关的分子遗传标记奠定基础.[方法]根据Gen-Bank已公布的鸡LPL基因序列设计引物,利用RT-PCR扩增广西三黄鸡和AA鸡的LPL基因cDNA序列,经双酶切鉴定和序列测定比对分析后,应用生物软件进行蛋白质二级结构预测分析.[结果]成功获得广西三黄鸡和AA鸡的LPL基因编码区序列(CDs),大小均为1473 bp,两者的同源性为99.4%;将广西三黄鸡LPL基因序列提交至GenBank获得序列号JX090309.相对于AA鸡,广西三黄鸡LPL基因CDs存在9个位点的碱基突变,其中碱基503T→C导致氨基酸168Val→Ala,606T→G导致202Asp→Glu,1066A→G导致356Thr→Ala,1277C→T导致426Ser→Phe,1420A→G导致474Arp→Gly,1432G→A导致202G1u→Lys,这6个位点为错义突变;第166、372和1305位点的碱基突变为同义突变.蛋白质二级结构预测结果表明,广西三黄鸡与AA鸡LPL的C端结构域存在空间构象差异.[结论]LPL基因突变引起的氨基酸组成变化及蛋白质二级构象改变,可能影响鸡肌内脂肪沉积,进而决定肉质的优劣,即LPL基因可作为研究广西三黄鸡肌内脂肪代谢的主要候选基因.
[目的]對廣西三黃鷄和愛拔益加(AA)鷄的脂蛋白脂酶基因(LPL)進行剋隆與蛋白質結構分析,為後期開展LPL基因錶達與鷄肌內脂肪含量相關性研究及篩選齣與優質肉質相關的分子遺傳標記奠定基礎.[方法]根據Gen-Bank已公佈的鷄LPL基因序列設計引物,利用RT-PCR擴增廣西三黃鷄和AA鷄的LPL基因cDNA序列,經雙酶切鑒定和序列測定比對分析後,應用生物軟件進行蛋白質二級結構預測分析.[結果]成功穫得廣西三黃鷄和AA鷄的LPL基因編碼區序列(CDs),大小均為1473 bp,兩者的同源性為99.4%;將廣西三黃鷄LPL基因序列提交至GenBank穫得序列號JX090309.相對于AA鷄,廣西三黃鷄LPL基因CDs存在9箇位點的堿基突變,其中堿基503T→C導緻氨基痠168Val→Ala,606T→G導緻202Asp→Glu,1066A→G導緻356Thr→Ala,1277C→T導緻426Ser→Phe,1420A→G導緻474Arp→Gly,1432G→A導緻202G1u→Lys,這6箇位點為錯義突變;第166、372和1305位點的堿基突變為同義突變.蛋白質二級結構預測結果錶明,廣西三黃鷄與AA鷄LPL的C耑結構域存在空間構象差異.[結論]LPL基因突變引起的氨基痠組成變化及蛋白質二級構象改變,可能影響鷄肌內脂肪沉積,進而決定肉質的優劣,即LPL基因可作為研究廣西三黃鷄肌內脂肪代謝的主要候選基因.
[목적]대엄서삼황계화애발익가(AA)계적지단백지매기인(LPL)진행극륭여단백질결구분석,위후기개전LPL기인표체여계기내지방함량상관성연구급사선출여우질육질상관적분자유전표기전정기출.[방법]근거Gen-Bank이공포적계LPL기인서렬설계인물,이용RT-PCR확증엄서삼황계화AA계적LPL기인cDNA서렬,경쌍매절감정화서렬측정비대분석후,응용생물연건진행단백질이급결구예측분석.[결과]성공획득엄서삼황계화AA계적LPL기인편마구서렬(CDs),대소균위1473 bp,량자적동원성위99.4%;장엄서삼황계LPL기인서렬제교지GenBank획득서렬호JX090309.상대우AA계,엄서삼황계LPL기인CDs존재9개위점적감기돌변,기중감기503T→C도치안기산168Val→Ala,606T→G도치202Asp→Glu,1066A→G도치356Thr→Ala,1277C→T도치426Ser→Phe,1420A→G도치474Arp→Gly,1432G→A도치202G1u→Lys,저6개위점위착의돌변;제166、372화1305위점적감기돌변위동의돌변.단백질이급결구예측결과표명,엄서삼황계여AA계LPL적C단결구역존재공간구상차이.[결론]LPL기인돌변인기적안기산조성변화급단백질이급구상개변,가능영향계기내지방침적,진이결정육질적우렬,즉LPL기인가작위연구엄서삼황계기내지방대사적주요후선기인.