湖北农业科学
湖北農業科學
호북농업과학
2014年
6期
1432-1435
,共4页
刘平%马玉韬%孙学宏%张成%杜勇
劉平%馬玉韜%孫學宏%張成%杜勇
류평%마옥도%손학굉%장성%두용
蛋白质编码区预测%窄通带滤波器%归一化的功率谱密度值%信噪比%近似相关系数
蛋白質編碼區預測%窄通帶濾波器%歸一化的功率譜密度值%信譟比%近似相關繫數
단백질편마구예측%착통대려파기%귀일화적공솔보밀도치%신조비%근사상관계수
protein coding regions prediction%narrow pass-band filter%normalized value of power spectrum density%ratio of signal to noise%approximate correlation
蛋白质编码区预测中阈值选择对预测结果的影响不容忽视.研究提出以归一化的功率谱密度作为判别DNA序列编码区和非编码区的阈值,以FIR (Finite impulse response,FIR)窄通带滤波器NPBF(Narrow pass band filter,NPBF)作为编码区预测算法核心,采用DNA序列集HMR195和ALLSEQ作为测试集,以碱基层的近似相关系数(Approximate correlation,AC)为预测准确率测度指标,对所提出方法与现有方法的预测结果做了比较.结果表明,采用新阈值得到的预测准确率最高,算法简单直观.
蛋白質編碼區預測中閾值選擇對預測結果的影響不容忽視.研究提齣以歸一化的功率譜密度作為判彆DNA序列編碼區和非編碼區的閾值,以FIR (Finite impulse response,FIR)窄通帶濾波器NPBF(Narrow pass band filter,NPBF)作為編碼區預測算法覈心,採用DNA序列集HMR195和ALLSEQ作為測試集,以堿基層的近似相關繫數(Approximate correlation,AC)為預測準確率測度指標,對所提齣方法與現有方法的預測結果做瞭比較.結果錶明,採用新閾值得到的預測準確率最高,算法簡單直觀.
단백질편마구예측중역치선택대예측결과적영향불용홀시.연구제출이귀일화적공솔보밀도작위판별DNA서렬편마구화비편마구적역치,이FIR (Finite impulse response,FIR)착통대려파기NPBF(Narrow pass band filter,NPBF)작위편마구예측산법핵심,채용DNA서렬집HMR195화ALLSEQ작위측시집,이감기층적근사상관계수(Approximate correlation,AC)위예측준학솔측도지표,대소제출방법여현유방법적예측결과주료비교.결과표명,채용신역치득도적예측준학솔최고,산법간단직관.
