生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2013年
4期
293-296
,共4页
王樟凤%柴学文%黄润红%彭武林%饶友生
王樟鳳%柴學文%黃潤紅%彭武林%饒友生
왕장봉%시학문%황윤홍%팽무림%요우생
珍珠鸟%小染色体%密码子偏性
珍珠鳥%小染色體%密碼子偏性
진주조%소염색체%밀마자편성
Zebra Finch%Micro-chromosome%Codon Bias
从NCBI数据库(http:∥www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/mapview/map)下载珍珠鸟全部小染色体基因的cDNA序列,最终共有l 586个基因的CDS序列纳入统计分析.密码子的偏性分析使用CodonW (1.4.2)完成,初步确定了UUC、UCC、UCG等27个密码子为珍珠鸟小染色体基因表达的“最优”密码子.对应分析表明,影响珍珠鸟小染色体基因密码子使用的主要因素分别为GC3s、CDS的GC含量基以及因的表达丰度.珍珠鸟小染色体基因的密码子用法受到了基因碱基组成的显著影响,其密码子的偏性是碱基组成及选择等因素综合作用的结果.本研究的目的是系统探究珍珠鸟小染色体基因的密码子用法,探究鸟类基因表达的分子调控机制.
從NCBI數據庫(http:∥www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/mapview/map)下載珍珠鳥全部小染色體基因的cDNA序列,最終共有l 586箇基因的CDS序列納入統計分析.密碼子的偏性分析使用CodonW (1.4.2)完成,初步確定瞭UUC、UCC、UCG等27箇密碼子為珍珠鳥小染色體基因錶達的“最優”密碼子.對應分析錶明,影響珍珠鳥小染色體基因密碼子使用的主要因素分彆為GC3s、CDS的GC含量基以及因的錶達豐度.珍珠鳥小染色體基因的密碼子用法受到瞭基因堿基組成的顯著影響,其密碼子的偏性是堿基組成及選擇等因素綜閤作用的結果.本研究的目的是繫統探究珍珠鳥小染色體基因的密碼子用法,探究鳥類基因錶達的分子調控機製.
종NCBI수거고(http:∥www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/mapview/map)하재진주조전부소염색체기인적cDNA서렬,최종공유l 586개기인적CDS서렬납입통계분석.밀마자적편성분석사용CodonW (1.4.2)완성,초보학정료UUC、UCC、UCG등27개밀마자위진주조소염색체기인표체적“최우”밀마자.대응분석표명,영향진주조소염색체기인밀마자사용적주요인소분별위GC3s、CDS적GC함량기이급인적표체봉도.진주조소염색체기인적밀마자용법수도료기인감기조성적현저영향,기밀마자적편성시감기조성급선택등인소종합작용적결과.본연구적목적시계통탐구진주조소염색체기인적밀마자용법,탐구조류기인표체적분자조공궤제.
