生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2013年
4期
264-270
,共7页
肖碧玉%李先彬%沈良忠%刘文斌
肖碧玉%李先彬%瀋良忠%劉文斌
초벽옥%리선빈%침량충%류문빈
差异网络%点的聚类系数%图元向量%小鼠衰老
差異網絡%點的聚類繫數%圖元嚮量%小鼠衰老
차이망락%점적취류계수%도원향량%소서쇠로
Differentially Network%Clustering Coefficient%Graphlet Orbit%Aging
差异分析对于揭示生命体的生长、发育和衰老过程及疾病发生具有重大的意义,基于网络的差异分析方法已经成为系统生物学的一个研究热点.网络节点往往通过与局部结构作用实现某种功能,其与局部结构的关系变化,很可能影响其功能.本文利用仿真实验的方法比较了图元向量和点的聚类系数两种局部结构测度的性能,并且利用他们分别设计算法挖掘差异网络中模块化变化的基因簇.应用AGEMAP数据库中小鼠12个组织基因表达数据进行实验,大部分聚类簇都高度显著富集与衰老相关的GO项.
差異分析對于揭示生命體的生長、髮育和衰老過程及疾病髮生具有重大的意義,基于網絡的差異分析方法已經成為繫統生物學的一箇研究熱點.網絡節點往往通過與跼部結構作用實現某種功能,其與跼部結構的關繫變化,很可能影響其功能.本文利用倣真實驗的方法比較瞭圖元嚮量和點的聚類繫數兩種跼部結構測度的性能,併且利用他們分彆設計算法挖掘差異網絡中模塊化變化的基因簇.應用AGEMAP數據庫中小鼠12箇組織基因錶達數據進行實驗,大部分聚類簇都高度顯著富集與衰老相關的GO項.
차이분석대우게시생명체적생장、발육화쇠로과정급질병발생구유중대적의의,기우망락적차이분석방법이경성위계통생물학적일개연구열점.망락절점왕왕통과여국부결구작용실현모충공능,기여국부결구적관계변화,흔가능영향기공능.본문이용방진실험적방법비교료도원향량화점적취류계수량충국부결구측도적성능,병차이용타문분별설계산법알굴차이망락중모괴화변화적기인족.응용AGEMAP수거고중소서12개조직기인표체수거진행실험,대부분취류족도고도현저부집여쇠로상관적GO항.
