生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2013年
4期
243-249
,共7页
朱梦丽%朱乾坤%邹嘉欣%冯沛春%范高韬%王万军
硃夢麗%硃乾坤%鄒嘉訢%馮沛春%範高韜%王萬軍
주몽려%주건곤%추가흔%풍패춘%범고도%왕만군
甘露糖结合凝集素%铁皮石斛%同源建模%分子对接
甘露糖結閤凝集素%鐵皮石斛%同源建模%分子對接
감로당결합응집소%철피석곡%동원건모%분자대접
Mannose-binding Lectin%Dendrobium Officinale%Homology Modeling%Molecular Docking
本文通过序列分析获得了铁皮石斛甘露糖结合凝聚素(Dendrobium officinale mannose-binding lectin,DOL)成熟肽和甘露糖结合位点(50-58AA,81-89AA,116-124AA).通过同源建模建立了DOL三维结构模型,DOL呈中空的三棱柱结构,三棱柱的三个侧面主要由β折叠构成,三个侧面各有一个甘露糖结合部位.甘露糖与DOL的分子对接和动力学分析表明,结合位点50-58AA和81-89AA对甘露糖的结合要强于116-124AA,在与甘露糖结合的过程中发挥关键作用的氨基酸残基为Gln81,Asp83,Asn85和Tyr89.研究结果有助于进一步开展凝集素抗病机理及凝集素相关药物研究.
本文通過序列分析穫得瞭鐵皮石斛甘露糖結閤凝聚素(Dendrobium officinale mannose-binding lectin,DOL)成熟肽和甘露糖結閤位點(50-58AA,81-89AA,116-124AA).通過同源建模建立瞭DOL三維結構模型,DOL呈中空的三稜柱結構,三稜柱的三箇側麵主要由β摺疊構成,三箇側麵各有一箇甘露糖結閤部位.甘露糖與DOL的分子對接和動力學分析錶明,結閤位點50-58AA和81-89AA對甘露糖的結閤要彊于116-124AA,在與甘露糖結閤的過程中髮揮關鍵作用的氨基痠殘基為Gln81,Asp83,Asn85和Tyr89.研究結果有助于進一步開展凝集素抗病機理及凝集素相關藥物研究.
본문통과서렬분석획득료철피석곡감로당결합응취소(Dendrobium officinale mannose-binding lectin,DOL)성숙태화감로당결합위점(50-58AA,81-89AA,116-124AA).통과동원건모건립료DOL삼유결구모형,DOL정중공적삼릉주결구,삼릉주적삼개측면주요유β절첩구성,삼개측면각유일개감로당결합부위.감로당여DOL적분자대접화동역학분석표명,결합위점50-58AA화81-89AA대감로당적결합요강우116-124AA,재여감로당결합적과정중발휘관건작용적안기산잔기위Gln81,Asp83,Asn85화Tyr89.연구결과유조우진일보개전응집소항병궤리급응집소상관약물연구.