农业生物技术学报
農業生物技術學報
농업생물기술학보
JOURNAL OF AGRICULTURAL BIOTECHNOLOGY
2013年
12期
1473-1478
,共6页
周催%孙娜%王翠燕%孙璐%车会莲
週催%孫娜%王翠燕%孫璐%車會蓮
주최%손나%왕취연%손로%차회련
豇豆胰蛋白酶抑制剂%潜在致敏性评价%生物信息学分析
豇豆胰蛋白酶抑製劑%潛在緻敏性評價%生物信息學分析
강두이단백매억제제%잠재치민성평개%생물신식학분석
Cowpea trypsin inhibitor%Assessment of potential allergenicity%Bioinformatics analysis
随着豇豆胰蛋白酶抑制剂基因(CpTI)近年来在棉花、水稻等农作物中的应用,CpTI在人类食物中的分布也日益广泛.作为一种外源蛋白,其致敏性越来越引起人们的关注,本研究对CpTI的潜在致敏性进行生物信息学分析,并与其他研究方法得到的结果进行比较,旨在进一步明确其潜在致敏性.在分析CpTI蛋白理化性质的基础上,使用DNAStar软件和Kolaskar-Tongaonkar在线服务器分别分析CpTI蛋白的抗原表位,同时使用致敏原在线数据库(Allergenonline)和致敏蛋白结构数据库(SDAP)中将CpTI氨基酸序列与己知致敏原序列进行比较分析其潜在致敏性.研究结果分析得到CpTI蛋白的抗原表位氨基酸区域可能为76~80,小于6个氨基酸,几乎不能形成抗原决定簇.另外,CpTI蛋白与己知致敏原中连续80个氨基酸的最高相似度为18.85%,没有发现CpTI具有与已知氨基酸序列完全相同的连续8个氨基酸.研究表明,抗原表位分析可以预测蛋白的免疫原性,而使用Allergenonline和SDAP数据库分析可以分析蛋白与己知致敏原之间的交叉反应性,从而预测其致敏性.采用这些方法对CpTI进行分析的结果显示,未发现其具有可形成抗原决定簇的抗原表位序列,与己知致敏原的相似度也没有达到产生交叉反应的程度.本研究显示,CpTI无致敏性或潜在致敏性很低,这将对使用生物信息学分析工具预测新型蛋白的潜在致敏性具有一定的参考意义.
隨著豇豆胰蛋白酶抑製劑基因(CpTI)近年來在棉花、水稻等農作物中的應用,CpTI在人類食物中的分佈也日益廣汎.作為一種外源蛋白,其緻敏性越來越引起人們的關註,本研究對CpTI的潛在緻敏性進行生物信息學分析,併與其他研究方法得到的結果進行比較,旨在進一步明確其潛在緻敏性.在分析CpTI蛋白理化性質的基礎上,使用DNAStar軟件和Kolaskar-Tongaonkar在線服務器分彆分析CpTI蛋白的抗原錶位,同時使用緻敏原在線數據庫(Allergenonline)和緻敏蛋白結構數據庫(SDAP)中將CpTI氨基痠序列與己知緻敏原序列進行比較分析其潛在緻敏性.研究結果分析得到CpTI蛋白的抗原錶位氨基痠區域可能為76~80,小于6箇氨基痠,幾乎不能形成抗原決定簇.另外,CpTI蛋白與己知緻敏原中連續80箇氨基痠的最高相似度為18.85%,沒有髮現CpTI具有與已知氨基痠序列完全相同的連續8箇氨基痠.研究錶明,抗原錶位分析可以預測蛋白的免疫原性,而使用Allergenonline和SDAP數據庫分析可以分析蛋白與己知緻敏原之間的交扠反應性,從而預測其緻敏性.採用這些方法對CpTI進行分析的結果顯示,未髮現其具有可形成抗原決定簇的抗原錶位序列,與己知緻敏原的相似度也沒有達到產生交扠反應的程度.本研究顯示,CpTI無緻敏性或潛在緻敏性很低,這將對使用生物信息學分析工具預測新型蛋白的潛在緻敏性具有一定的參攷意義.
수착강두이단백매억제제기인(CpTI)근년래재면화、수도등농작물중적응용,CpTI재인류식물중적분포야일익엄범.작위일충외원단백,기치민성월래월인기인문적관주,본연구대CpTI적잠재치민성진행생물신식학분석,병여기타연구방법득도적결과진행비교,지재진일보명학기잠재치민성.재분석CpTI단백이화성질적기출상,사용DNAStar연건화Kolaskar-Tongaonkar재선복무기분별분석CpTI단백적항원표위,동시사용치민원재선수거고(Allergenonline)화치민단백결구수거고(SDAP)중장CpTI안기산서렬여기지치민원서렬진행비교분석기잠재치민성.연구결과분석득도CpTI단백적항원표위안기산구역가능위76~80,소우6개안기산,궤호불능형성항원결정족.령외,CpTI단백여기지치민원중련속80개안기산적최고상사도위18.85%,몰유발현CpTI구유여이지안기산서렬완전상동적련속8개안기산.연구표명,항원표위분석가이예측단백적면역원성,이사용Allergenonline화SDAP수거고분석가이분석단백여기지치민원지간적교차반응성,종이예측기치민성.채용저사방법대CpTI진행분석적결과현시,미발현기구유가형성항원결정족적항원표위서렬,여기지치민원적상사도야몰유체도산생교차반응적정도.본연구현시,CpTI무치민성혹잠재치민성흔저,저장대사용생물신식학분석공구예측신형단백적잠재치민성구유일정적삼고의의.