CAJ | 학술논문

利用454高通量测序技术对枣基因组进行部分测序.经序列拼接,共获得总长约为8.4 Mb的基因组序列,从中找到15 036个微卫星重复序列.其中六碱基重复类型的重复数目最丰富,共6 033个,占重复序列总数的40.1％;其次是复合型碱基2 707个和单碱基2 575个,分别占重复序列总数的18.0％和17.1％.另外,二碱基重复l 118个,三碱基1 050个,四碱基1 218个,五碱基335个,分别占重复序列总数的7.5％,7.0％,8.1％,2.2％.通过分析发现六碱基重复类型所占比例最多,但微卫星重复单元的重复次数变化却是二碱基微卫星显著高于其他各重复类型.在单碱基重复和二碱基重复这2种类型中,A/T以及AT/TA为最主要的重复单元;(AAN)n,(AAAN)n,(AAAAN)n和(AAAAAN)n为三碱基、四碱基、五碱基、六碱基重复类型中对应的优势重复单元,这些优势重复单元中富含A和T碱基.分析还发现,枣基因组微卫星长度变化的多样性与重复单元长度呈负相关(二碱基重复类型除外),这意味着枣基因组中重复单元较短的微卫星变异速率较快,而重复单元较长的微卫星变异速率较慢.对枣基因组微卫星侧翼序列分析发现,左侧序列与右侧序列GC含量相差不大;设计的引物序列中,有86％的引物可以特异扩增出含有SSR序列的位点.研究结果为枣的遗传研究提供丰富的序列信息和标记资源.
이용454고통량측서기술대조기인조진행부분측서.경서렬병접,공획득총장약위8.4 Mb적기인조서렬,종중조도15 036개미위성중복서렬.기중륙감기중복류형적중복수목최봉부,공6 033개,점중복서렬총수적40.1％;기차시복합형감기2 707개화단감기2 575개,분별점중복서렬총수적18.0％화17.1％.령외,이감기중복l 118개,삼감기1 050개,사감기1 218개,오감기335개,분별점중복서렬총수적7.5％,7.0％,8.1％,2.2％.통과분석발현륙감기중복류형소점비례최다,단미위성중복단원적중복차수변화각시이감기미위성현저고우기타각중복류형.재단감기중복화이감기중복저2충류형중,A/T이급AT/TA위최주요적중복단원;(AAN)n,(AAAN)n,(AAAAN)n화(AAAAAN)n위삼감기、사감기、오감기、륙감기중복류형중대응적우세중복단원,저사우세중복단원중부함A화T감기.분석환발현,조기인조미위성장도변화적다양성여중복단원장도정부상관(이감기중복류형제외),저의미착조기인조중중복단원교단적미위성변이속솔교쾌,이중복단원교장적미위성변이속솔교만.대조기인조미위성측익서렬분석발현,좌측서렬여우측서렬GC함량상차불대;설계적인물서렬중,유86％적인물가이특이확증출함유SSR서렬적위점.연구결과위조적유전연구제공봉부적서렬신식화표기자원.