中国药物与临床
中國藥物與臨床
중국약물여림상
CHINESE REMEDIES & CLINICS
2014年
1期
5-8
,共4页
癌,移行细胞%膀胱肿瘤%计算生物学
癌,移行細胞%膀胱腫瘤%計算生物學
암,이행세포%방광종류%계산생물학
目的 ①对表达序列标签(EST)片段BQ135230 进行全长扩增并应用生物信息学推测其开放阅读框(ORF)、染色体定位和功能.方法 ①从新鲜的膀胱肿瘤组织中提取RNA,并用快速cDNA 末端扩增技术(RACE)方法获得BQ135230的5′端和3′端的DNA序列,然后应用GeneTool 软件合成RACE测序结果.②根据NCBI 提供的ORF Finder 程序、电子-聚合酶链反应(e-PCR)程序、Blastn、Blastp,同时应用ExPASY ProtParamTool、JUFO 软件并结合Primer 软件对AY887902全长及其相应蛋白AAX14401进行分析.Sequin 软件编辑前述结果,上报NCBI GenBank,获取基因库获得序列号(GenBank accession number).结果 通过RACE 得到了BQ135230 的5′和3′端,GeneTool 合成一个774 bp 的全长序列.该序列在GenBank 获得序列号(accession num-ber):AY887902,初步分析含有完整的ORF 和poly A 尾.ORF 翻译的多肽序列获得蛋白ID 号AAX14401;染色体定位11q13,与GSTP1 基因位置完全一致.AY887902 的193~195 位编码赖氨酸的碱基AAA 突变为终止子TGA,从而使有210个氨基酸的GSTP1突变为只有52个氨基酸的多肽,该假定蛋白不是跨膜蛋白和信号肽.结论 ①获得BQ135230的全长序列AY887902,推测该序列是GSTP1基因的突变体.②AAX14401在膀胱肿瘤的表达可能是膀胱癌发生发展的新的机制,为膀胱癌Ⅱ类癌提供了分子学标志,同时它有可能成为新的治疗靶点.
目的 ①對錶達序列標籤(EST)片段BQ135230 進行全長擴增併應用生物信息學推測其開放閱讀框(ORF)、染色體定位和功能.方法 ①從新鮮的膀胱腫瘤組織中提取RNA,併用快速cDNA 末耑擴增技術(RACE)方法穫得BQ135230的5′耑和3′耑的DNA序列,然後應用GeneTool 軟件閤成RACE測序結果.②根據NCBI 提供的ORF Finder 程序、電子-聚閤酶鏈反應(e-PCR)程序、Blastn、Blastp,同時應用ExPASY ProtParamTool、JUFO 軟件併結閤Primer 軟件對AY887902全長及其相應蛋白AAX14401進行分析.Sequin 軟件編輯前述結果,上報NCBI GenBank,穫取基因庫穫得序列號(GenBank accession number).結果 通過RACE 得到瞭BQ135230 的5′和3′耑,GeneTool 閤成一箇774 bp 的全長序列.該序列在GenBank 穫得序列號(accession num-ber):AY887902,初步分析含有完整的ORF 和poly A 尾.ORF 翻譯的多肽序列穫得蛋白ID 號AAX14401;染色體定位11q13,與GSTP1 基因位置完全一緻.AY887902 的193~195 位編碼賴氨痠的堿基AAA 突變為終止子TGA,從而使有210箇氨基痠的GSTP1突變為隻有52箇氨基痠的多肽,該假定蛋白不是跨膜蛋白和信號肽.結論 ①穫得BQ135230的全長序列AY887902,推測該序列是GSTP1基因的突變體.②AAX14401在膀胱腫瘤的錶達可能是膀胱癌髮生髮展的新的機製,為膀胱癌Ⅱ類癌提供瞭分子學標誌,同時它有可能成為新的治療靶點.
목적 ①대표체서렬표첨(EST)편단BQ135230 진행전장확증병응용생물신식학추측기개방열독광(ORF)、염색체정위화공능.방법 ①종신선적방광종류조직중제취RNA,병용쾌속cDNA 말단확증기술(RACE)방법획득BQ135230적5′단화3′단적DNA서렬,연후응용GeneTool 연건합성RACE측서결과.②근거NCBI 제공적ORF Finder 정서、전자-취합매련반응(e-PCR)정서、Blastn、Blastp,동시응용ExPASY ProtParamTool、JUFO 연건병결합Primer 연건대AY887902전장급기상응단백AAX14401진행분석.Sequin 연건편집전술결과,상보NCBI GenBank,획취기인고획득서렬호(GenBank accession number).결과 통과RACE 득도료BQ135230 적5′화3′단,GeneTool 합성일개774 bp 적전장서렬.해서렬재GenBank 획득서렬호(accession num-ber):AY887902,초보분석함유완정적ORF 화poly A 미.ORF 번역적다태서렬획득단백ID 호AAX14401;염색체정위11q13,여GSTP1 기인위치완전일치.AY887902 적193~195 위편마뢰안산적감기AAA 돌변위종지자TGA,종이사유210개안기산적GSTP1돌변위지유52개안기산적다태,해가정단백불시과막단백화신호태.결론 ①획득BQ135230적전장서렬AY887902,추측해서렬시GSTP1기인적돌변체.②AAX14401재방광종류적표체가능시방광암발생발전적신적궤제,위방광암Ⅱ유암제공료분자학표지,동시타유가능성위신적치료파점.
