水产学杂志
水產學雜誌
수산학잡지
CHINESE JOURNAL OF FISHERIES
2014年
2期
20-24
,共5页
王友超%周井祥%王好%邢程
王友超%週井祥%王好%邢程
왕우초%주정상%왕호%형정
锦鲤疱疹病毒%ORF27基因%生物信息学分析
錦鯉皰疹病毒%ORF27基因%生物信息學分析
금리포진병독%ORF27기인%생물신식학분석
为了解锦鲤疱疹病毒中国吉林株(KHV-CJ)ORF27基因编码蛋白的结构特征和进化关系,采用镜鲤尾鳍原代细胞增殖KHV-CJ,提取其DNA,经PCR扩增,获得ORF27基因,将其克隆在pMD18-T载体中,构建重组质粒。应用生物信息学方法初步分析KHV-CJ ORF27基因的结构和功能,并与GenBank上公布的三株KHV构建系统进化树。结果显示:获得207bp的ORF27基因,编码69个氨基酸;预测ORF27编码蛋白的理论分子质量为7366.62Da,等电点为4.487;抗原表位预测显示抗原性良好;编码蛋白存在1个N-糖基化位点、4个O糖基化位点和5个磷酸化位点;系统进化树分析表明与锦鲤疱疹病毒美国株(KHV-U)属同一分支。
為瞭解錦鯉皰疹病毒中國吉林株(KHV-CJ)ORF27基因編碼蛋白的結構特徵和進化關繫,採用鏡鯉尾鰭原代細胞增殖KHV-CJ,提取其DNA,經PCR擴增,穫得ORF27基因,將其剋隆在pMD18-T載體中,構建重組質粒。應用生物信息學方法初步分析KHV-CJ ORF27基因的結構和功能,併與GenBank上公佈的三株KHV構建繫統進化樹。結果顯示:穫得207bp的ORF27基因,編碼69箇氨基痠;預測ORF27編碼蛋白的理論分子質量為7366.62Da,等電點為4.487;抗原錶位預測顯示抗原性良好;編碼蛋白存在1箇N-糖基化位點、4箇O糖基化位點和5箇燐痠化位點;繫統進化樹分析錶明與錦鯉皰疹病毒美國株(KHV-U)屬同一分支。
위료해금리포진병독중국길림주(KHV-CJ)ORF27기인편마단백적결구특정화진화관계,채용경리미기원대세포증식KHV-CJ,제취기DNA,경PCR확증,획득ORF27기인,장기극륭재pMD18-T재체중,구건중조질립。응용생물신식학방법초보분석KHV-CJ ORF27기인적결구화공능,병여GenBank상공포적삼주KHV구건계통진화수。결과현시:획득207bp적ORF27기인,편마69개안기산;예측ORF27편마단백적이론분자질량위7366.62Da,등전점위4.487;항원표위예측현시항원성량호;편마단백존재1개N-당기화위점、4개O당기화위점화5개린산화위점;계통진화수분석표명여금리포진병독미국주(KHV-U)속동일분지。