中国人兽共患病学报
中國人獸共患病學報
중국인수공환병학보
CHINESE JOURNAL OF ZOONOSES
2013年
5期
472-475
,共4页
刘转转%杨燕萍%郑葵阳%刘宜升
劉轉轉%楊燕萍%鄭葵暘%劉宜升
류전전%양연평%정규양%류의승
刚地弓形虫%苹果酸脱氢酶%生物信息学%抗原表位%免疫原性
剛地弓形蟲%蘋果痠脫氫酶%生物信息學%抗原錶位%免疫原性
강지궁형충%평과산탈경매%생물신식학%항원표위%면역원성
目的 用生物信息学方法分析刚地弓形虫苹果酸脱氢酶(TgMDH)基因编码蛋白的结构与抗原表位,预测该蛋白的免疫原性.方法 利用蛋白分析专家系统(ExPASy)提供的ProtParam、SOSUI、TMPRED、HNN、MotifScan和NCBI上的ORF finder、SignalP、Bcepred等生物信息学在线分析程序,结合Gene Runner和DNAMAN等生物信息学软件,分析并预测TgMDH蛋白的开放阅读框、理化性质、可溶性、信号肽、跨膜区、表面可及性、可塑性、亲(疏)水性、翻译后修饰位点、二级结构及抗原表位,通过CPHmodels程序预测该蛋白的三维空间结构.结果 TgMDH蛋白由316个氨基酸组成,分子式为C1498H2454N402O440S20,分子质量单位为33 777.5,等电点为6.01,波长280 nm时的吸光度(A)值为0.364,半衰期为30 h,有9个表面可及性参数≥1.9的区域、4个亲水性参数得分≥1.9的区域、7个柔韧性参数得分≥2的区域、14个翻译后修饰位点和14个潜在抗原表位,为可溶性表达蛋白.结论 TgMDH基因编码蛋白为可溶性蛋白,有多个抗原表位,具有免疫原性,可作为弓形虫病疫苗候选抗原.
目的 用生物信息學方法分析剛地弓形蟲蘋果痠脫氫酶(TgMDH)基因編碼蛋白的結構與抗原錶位,預測該蛋白的免疫原性.方法 利用蛋白分析專傢繫統(ExPASy)提供的ProtParam、SOSUI、TMPRED、HNN、MotifScan和NCBI上的ORF finder、SignalP、Bcepred等生物信息學在線分析程序,結閤Gene Runner和DNAMAN等生物信息學軟件,分析併預測TgMDH蛋白的開放閱讀框、理化性質、可溶性、信號肽、跨膜區、錶麵可及性、可塑性、親(疏)水性、翻譯後脩飾位點、二級結構及抗原錶位,通過CPHmodels程序預測該蛋白的三維空間結構.結果 TgMDH蛋白由316箇氨基痠組成,分子式為C1498H2454N402O440S20,分子質量單位為33 777.5,等電點為6.01,波長280 nm時的吸光度(A)值為0.364,半衰期為30 h,有9箇錶麵可及性參數≥1.9的區域、4箇親水性參數得分≥1.9的區域、7箇柔韌性參數得分≥2的區域、14箇翻譯後脩飾位點和14箇潛在抗原錶位,為可溶性錶達蛋白.結論 TgMDH基因編碼蛋白為可溶性蛋白,有多箇抗原錶位,具有免疫原性,可作為弓形蟲病疫苗候選抗原.
목적 용생물신식학방법분석강지궁형충평과산탈경매(TgMDH)기인편마단백적결구여항원표위,예측해단백적면역원성.방법 이용단백분석전가계통(ExPASy)제공적ProtParam、SOSUI、TMPRED、HNN、MotifScan화NCBI상적ORF finder、SignalP、Bcepred등생물신식학재선분석정서,결합Gene Runner화DNAMAN등생물신식학연건,분석병예측TgMDH단백적개방열독광、이화성질、가용성、신호태、과막구、표면가급성、가소성、친(소)수성、번역후수식위점、이급결구급항원표위,통과CPHmodels정서예측해단백적삼유공간결구.결과 TgMDH단백유316개안기산조성,분자식위C1498H2454N402O440S20,분자질량단위위33 777.5,등전점위6.01,파장280 nm시적흡광도(A)치위0.364,반쇠기위30 h,유9개표면가급성삼수≥1.9적구역、4개친수성삼수득분≥1.9적구역、7개유인성삼수득분≥2적구역、14개번역후수식위점화14개잠재항원표위,위가용성표체단백.결론 TgMDH기인편마단백위가용성단백,유다개항원표위,구유면역원성,가작위궁형충병역묘후선항원.
