CAJ | 학술논문

R/qtl是基于R语言的QTL分析专用作图软件.为了研究R/qtl不同作图方法在分析结果上的差异,采用1个玉米F2∶3家系的株高实际数据,分别按该软件提供的区间作图法(IM)、复合区间作图法(CIM)、二维扫描和多QTL拟合进行数据分析和结果比较.在株高性状上共定位到8个QTL,其中,IM法检测到7个,总共解释表型变异的54.57％,有3个QTL在4种算法中都能检测到,其位置、LOD值、置信区间以及贡献率估计4种算法分析结果基本一致.CIM法共检测到5个QTL,可解释总变异的27.66％,其中,位于第3染色体158 cM和222 cM的2个QTL在所有4种算法中都能检测到,第7染色体36 cM处的QTL首次被检测到,其余4个QTL与IM法检测到的相应QTL一致.二维QTL扫描共检测到7个QTL,累计贡献率达到54.97％,未检测到显著互作的QTL,除第6染色体33.5 cM处的QTL外,其他QTL与IM法检测到的一致.多QTL拟合只检测到3个QTL,累计贡献率为21.52％,也未检测到QTL间显著互作.以上分析结果表明:不同方法检测到的QTL无论在数量上还是在贡献率估计上均存在一定程度上的差异,但一些主要QTL在用不同方法分析中通常都能被发现.此外,本研究群体株高性状的遗传模式仅有主效应QTL,上位性QTL均未检测到.
R/qtl시기우R어언적QTL분석전용작도연건.위료연구R/qtl불동작도방법재분석결과상적차이,채용1개옥미F2∶3가계적주고실제수거,분별안해연건제공적구간작도법(IM)、복합구간작도법(CIM)、이유소묘화다QTL의합진행수거분석화결과비교.재주고성상상공정위도8개QTL,기중,IM법검측도7개,총공해석표형변이적54.57％,유3개QTL재4충산법중도능검측도,기위치、LOD치、치신구간이급공헌솔고계4충산법분석결과기본일치.CIM법공검측도5개QTL,가해석총변이적27.66％,기중,위우제3염색체158 cM화222 cM적2개QTL재소유4충산법중도능검측도,제7염색체36 cM처적QTL수차피검측도,기여4개QTL여IM법검측도적상응QTL일치.이유QTL소묘공검측도7개QTL,루계공헌솔체도54.97％,미검측도현저호작적QTL,제제6염색체33.5 cM처적QTL외,기타QTL여IM법검측도적일치.다QTL의합지검측도3개QTL,루계공헌솔위21.52％,야미검측도QTL간현저호작.이상분석결과표명:불동방법검측도적QTL무론재수량상환시재공헌솔고계상균존재일정정도상적차이,단일사주요QTL재용불동방법분석중통상도능피발현.차외,본연구군체주고성상적유전모식부유주효응QTL,상위성QTL균미검측도.