华侨大学学报（自然科学版）
華僑大學學報（自然科學版）
화교대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF HUAQIAO UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE)
2013年
2期
169-175
,共7页
嗜盐酶%非嗜盐酶%动力组学%分子动力学模拟%嗜盐机理
嗜鹽酶%非嗜鹽酶%動力組學%分子動力學模擬%嗜鹽機理
기염매%비기염매%동력조학%분자동역학모의%기염궤리
通过分子动力组学的方法,从原子尺度上分析4组嗜盐酶及其同源非嗜盐酶的分子动力学特性.结果发现:嗜盐酶所形成的盐桥和氢键明显多于非嗜盐酶,嗜盐酶的溶剂可及性表面要小于非嗜盐酶.通过比较嗜盐与非嗜盐的均方根偏差、回旋半径及末端距等参数,发现嗜盐酶的结构较非嗜盐酶更具刚性.同时,非嗜盐酶多个部位的氨基酸残基柔性比嗜盐酶的要大很多.研究表明:能形成较多的盐桥、氢键,较小的溶剂可及性表面和整体结构的刚性,很可能是嗜盐酶在高盐环境中维持其结构稳定的主要原因.
通過分子動力組學的方法,從原子呎度上分析4組嗜鹽酶及其同源非嗜鹽酶的分子動力學特性.結果髮現:嗜鹽酶所形成的鹽橋和氫鍵明顯多于非嗜鹽酶,嗜鹽酶的溶劑可及性錶麵要小于非嗜鹽酶.通過比較嗜鹽與非嗜鹽的均方根偏差、迴鏇半徑及末耑距等參數,髮現嗜鹽酶的結構較非嗜鹽酶更具剛性.同時,非嗜鹽酶多箇部位的氨基痠殘基柔性比嗜鹽酶的要大很多.研究錶明:能形成較多的鹽橋、氫鍵,較小的溶劑可及性錶麵和整體結構的剛性,很可能是嗜鹽酶在高鹽環境中維持其結構穩定的主要原因.
통과분자동력조학적방법,종원자척도상분석4조기염매급기동원비기염매적분자동역학특성.결과발현:기염매소형성적염교화경건명현다우비기염매,기염매적용제가급성표면요소우비기염매.통과비교기염여비기염적균방근편차、회선반경급말단거등삼수,발현기염매적결구교비기염매경구강성.동시,비기염매다개부위적안기산잔기유성비기염매적요대흔다.연구표명:능형성교다적염교、경건,교소적용제가급성표면화정체결구적강성,흔가능시기염매재고염배경중유지기결구은정적주요원인.
