农业生物技术学报
農業生物技術學報
농업생물기술학보
JOURNAL OF AGRICULTURAL BIOTECHNOLOGY
2013年
3期
313-319
,共7页
王乐乐%李国喜%康相涛%张锁%孙桂荣
王樂樂%李國喜%康相濤%張鎖%孫桂榮
왕악악%리국희%강상도%장쇄%손계영
鸡%let-7a%组织表达谱%功能预测
鷄%let-7a%組織錶達譜%功能預測
계%let-7a%조직표체보%공능예측
前期对固始鸡1日龄和36周龄下丘脑miRNA的Solexa测序分析表明,let-7a为鸡(Gallus domesticus)下丘脑发育过程高丰度差异性表达miRNA.为全面了解鸡let-7a的功能,采用实时定量PCR检测了1日龄和36周龄固始鸡两个发育阶段13种组织中let-7a的表达情况.结果表明:let-7a在所检测的组织中呈广泛性表达,其在下丘脑中的表达趋势与高通量测序结果一致;1日龄时,let-7a在下丘脑和肾脏中高丰度表达,在肺中低丰度表达,其他组织中适度表达;36周龄时,let-7a在各组织中的表达量都较低,除了在肺中的表达量较1日龄上升外,其余各组织的表达量都下降.同时,采用两种算法预测了let-7a的靶基因,并对107个共有靶基因进行了基因本体功能(Go)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,结果显示:靶基因主要在生物学过程调节相关的生物学过程中富集,尤其是与矿物质和磷代谢相关的调节过程;且在粘着斑、细胞外基质受体互作、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路等3个通路中显著富集(P<0.01).这些结果为进一步研究let-7a功能提供了有益线索.
前期對固始鷄1日齡和36週齡下丘腦miRNA的Solexa測序分析錶明,let-7a為鷄(Gallus domesticus)下丘腦髮育過程高豐度差異性錶達miRNA.為全麵瞭解鷄let-7a的功能,採用實時定量PCR檢測瞭1日齡和36週齡固始鷄兩箇髮育階段13種組織中let-7a的錶達情況.結果錶明:let-7a在所檢測的組織中呈廣汎性錶達,其在下丘腦中的錶達趨勢與高通量測序結果一緻;1日齡時,let-7a在下丘腦和腎髒中高豐度錶達,在肺中低豐度錶達,其他組織中適度錶達;36週齡時,let-7a在各組織中的錶達量都較低,除瞭在肺中的錶達量較1日齡上升外,其餘各組織的錶達量都下降.同時,採用兩種算法預測瞭let-7a的靶基因,併對107箇共有靶基因進行瞭基因本體功能(Go)富集分析和京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路分析,結果顯示:靶基因主要在生物學過程調節相關的生物學過程中富集,尤其是與礦物質和燐代謝相關的調節過程;且在粘著斑、細胞外基質受體互作、絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)信號通路等3箇通路中顯著富集(P<0.01).這些結果為進一步研究let-7a功能提供瞭有益線索.
전기대고시계1일령화36주령하구뇌miRNA적Solexa측서분석표명,let-7a위계(Gallus domesticus)하구뇌발육과정고봉도차이성표체miRNA.위전면료해계let-7a적공능,채용실시정량PCR검측료1일령화36주령고시계량개발육계단13충조직중let-7a적표체정황.결과표명:let-7a재소검측적조직중정엄범성표체,기재하구뇌중적표체추세여고통량측서결과일치;1일령시,let-7a재하구뇌화신장중고봉도표체,재폐중저봉도표체,기타조직중괄도표체;36주령시,let-7a재각조직중적표체량도교저,제료재폐중적표체량교1일령상승외,기여각조직적표체량도하강.동시,채용량충산법예측료let-7a적파기인,병대107개공유파기인진행료기인본체공능(Go)부집분석화경도기인여기인조백과전서(KEGG)통로분석,결과현시:파기인주요재생물학과정조절상관적생물학과정중부집,우기시여광물질화린대사상관적조절과정;차재점착반、세포외기질수체호작、사렬원활화단백격매(MAPK)신호통로등3개통로중현저부집(P<0.01).저사결과위진일보연구let-7a공능제공료유익선색.