电子学报
電子學報
전자학보
ACTA ELECTRONICA SINICA
2013年
3期
513-518
,共6页
周家锐%纪震%朱泽轩%陈思平
週傢銳%紀震%硃澤軒%陳思平
주가예%기진%주택헌%진사평
DNA序列数据压缩%生物信息学%近似重复矢量%Memetic算法
DNA序列數據壓縮%生物信息學%近似重複矢量%Memetic算法
DNA서렬수거압축%생물신식학%근사중복시량%Memetic산법
提出近似重复矢量(Approximate Repeat Vector,ARV)模型用于DNA序列冗余片段的描述.通过将数据生物信息学特征引入压缩预处理,并使用ARV矢量构造编码码本,提出了非对称DNA序列压缩算法BioLZMA-2.算法引入基于粒子群优化的Memetic改进方法CLIPSO-MA用于压缩码本的智能优化设计,有效提升了编码性能.在标准测试序列上的实验结果表明,BioLZMA-2可获得比现有DNA序列数据压缩方法更高的压缩率.
提齣近似重複矢量(Approximate Repeat Vector,ARV)模型用于DNA序列冗餘片段的描述.通過將數據生物信息學特徵引入壓縮預處理,併使用ARV矢量構造編碼碼本,提齣瞭非對稱DNA序列壓縮算法BioLZMA-2.算法引入基于粒子群優化的Memetic改進方法CLIPSO-MA用于壓縮碼本的智能優化設計,有效提升瞭編碼性能.在標準測試序列上的實驗結果錶明,BioLZMA-2可穫得比現有DNA序列數據壓縮方法更高的壓縮率.
제출근사중복시량(Approximate Repeat Vector,ARV)모형용우DNA서렬용여편단적묘술.통과장수거생물신식학특정인입압축예처리,병사용ARV시량구조편마마본,제출료비대칭DNA서렬압축산법BioLZMA-2.산법인입기우입자군우화적Memetic개진방법CLIPSO-MA용우압축마본적지능우화설계,유효제승료편마성능.재표준측시서렬상적실험결과표명,BioLZMA-2가획득비현유DNA서렬수거압축방법경고적압축솔.
