生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2013年
1期
1-10
,共10页
孙龙霄%王淑栋%李凯凯%孟大志
孫龍霄%王淑棟%李凱凱%孟大誌
손룡소%왕숙동%리개개%맹대지
系统生物学%基因网络%相继故障%介数%结构性关键基因
繫統生物學%基因網絡%相繼故障%介數%結構性關鍵基因
계통생물학%기인망락%상계고장%개수%결구성관건기인
Systems Biology%Gene Network%Cascading Failure%Betweenness Centrality%Structural Key Gene
癌相关基因在疾病发生与发展过程中的作用机理是非常重要的研究课题.现代数据分析方法,为从基因组数据中推断癌相关基因之间的关联,以及分析基因组的作用机理提供了有效的手段.本文根据基因表达谱数据分别建立了正常组织与神经胶质瘤和肾癌的患病组织的基因互信息网络.用以介数为基础的相继故障模型研究了基因网络结构与鲁棒性之间的关系.定义了网络相继故障节点百分比、平均相继故障规模和相继故障规模比例累积概率等衡量网络鲁棒性的结构参数.通过对照组与实验组之间的比对,我们发现实验组网络比对照组网络更加稳定,并将引起网络大规模相继故障的基因称为结构性关键基因.这些结构性关键基因中的一部分已经被证明与神经胶质瘤或肾癌的发生、发展有密切关系.大多数基因被预测在神经胶质瘤和肾癌的发生中起着激励或抑制作用,需要进一步的试验验证.预测信息为研究癌相关基因提供了新的方向.
癌相關基因在疾病髮生與髮展過程中的作用機理是非常重要的研究課題.現代數據分析方法,為從基因組數據中推斷癌相關基因之間的關聯,以及分析基因組的作用機理提供瞭有效的手段.本文根據基因錶達譜數據分彆建立瞭正常組織與神經膠質瘤和腎癌的患病組織的基因互信息網絡.用以介數為基礎的相繼故障模型研究瞭基因網絡結構與魯棒性之間的關繫.定義瞭網絡相繼故障節點百分比、平均相繼故障規模和相繼故障規模比例纍積概率等衡量網絡魯棒性的結構參數.通過對照組與實驗組之間的比對,我們髮現實驗組網絡比對照組網絡更加穩定,併將引起網絡大規模相繼故障的基因稱為結構性關鍵基因.這些結構性關鍵基因中的一部分已經被證明與神經膠質瘤或腎癌的髮生、髮展有密切關繫.大多數基因被預測在神經膠質瘤和腎癌的髮生中起著激勵或抑製作用,需要進一步的試驗驗證.預測信息為研究癌相關基因提供瞭新的方嚮.
암상관기인재질병발생여발전과정중적작용궤리시비상중요적연구과제.현대수거분석방법,위종기인조수거중추단암상관기인지간적관련,이급분석기인조적작용궤리제공료유효적수단.본문근거기인표체보수거분별건립료정상조직여신경효질류화신암적환병조직적기인호신식망락.용이개수위기출적상계고장모형연구료기인망락결구여로봉성지간적관계.정의료망락상계고장절점백분비、평균상계고장규모화상계고장규모비례루적개솔등형량망락로봉성적결구삼수.통과대조조여실험조지간적비대,아문발현실험조망락비대조조망락경가은정,병장인기망락대규모상계고장적기인칭위결구성관건기인.저사결구성관건기인중적일부분이경피증명여신경효질류혹신암적발생、발전유밀절관계.대다수기인피예측재신경효질류화신암적발생중기착격려혹억제작용,수요진일보적시험험증.예측신식위연구암상관기인제공료신적방향.
