浙江海洋学院学报(自然科学版)
浙江海洋學院學報(自然科學版)
절강해양학원학보(자연과학판)
JOURNAL OF ZHEJIANG OCEAN UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE)
2013年
2期
93-98
,共6页
李鹏飞%贺舟挺%徐开达%朱文斌%薛利建%张洪亮
李鵬飛%賀舟挺%徐開達%硃文斌%薛利建%張洪亮
리붕비%하주정%서개체%주문빈%설리건%장홍량
东海%鳓鱼%COⅠ基因%D-loop序列%种质资源%遗传变异
東海%鰳魚%COⅠ基因%D-loop序列%種質資源%遺傳變異
동해%륵어%COⅠ기인%D-loop서렬%충질자원%유전변이
以东海区鳓鱼背部肌肉的线粒体DNA作为模板,对16个个体的CO Ⅰ基因和D-loop序列进行了扩增,通过对PCR产物进行双向测序,最终得到了691 bp的CO Ⅰ基因片段和718 bp的D-loop序列片断.用DNASP软件分析得知,16个CO Ⅰ基因序列定义了6个单倍型(在GenBank登录号:HM030765-HM030768,HM030769-HM030770),在6个单倍型中,共检测到6个变异位点,其中有5个变异位点发生在第三密码子位置上,有1个变异位点发生在第一密码子位置上.东海区鳓鱼16个个体D-loop序列共定义了14个单倍型(GenBank登录号:HM030781,HM030783-HM030792,HM030794-HM030796).除去插入/缺失位点,14个单倍型共检测到30个多态位点,主要发生在D-loop序列的两端区域;D-loop序列还检测到80个插入或缺失位点,碱基插入主要发生在340~419 bp之间的中央区域,以40 bp重复片断插入的形式进行.每个个体含有2~4个连续重复片断.对鳓鱼进行了遗传多样性分析,CO Ⅰ基因序列的单倍型多样性为0.617,核苷酸多样性指数为0.001 37,平均核苷酸差异数为0.950.D-loop序列的单倍型多样性为0.983,核苷酸多样性指数为0.009 98,平均核苷酸差异数为6.367.综合分析,东海区鳓鱼的遗传多样性并不高,有必要采取综合措施对其进行种质资源保护.
以東海區鰳魚揹部肌肉的線粒體DNA作為模闆,對16箇箇體的CO Ⅰ基因和D-loop序列進行瞭擴增,通過對PCR產物進行雙嚮測序,最終得到瞭691 bp的CO Ⅰ基因片段和718 bp的D-loop序列片斷.用DNASP軟件分析得知,16箇CO Ⅰ基因序列定義瞭6箇單倍型(在GenBank登錄號:HM030765-HM030768,HM030769-HM030770),在6箇單倍型中,共檢測到6箇變異位點,其中有5箇變異位點髮生在第三密碼子位置上,有1箇變異位點髮生在第一密碼子位置上.東海區鰳魚16箇箇體D-loop序列共定義瞭14箇單倍型(GenBank登錄號:HM030781,HM030783-HM030792,HM030794-HM030796).除去插入/缺失位點,14箇單倍型共檢測到30箇多態位點,主要髮生在D-loop序列的兩耑區域;D-loop序列還檢測到80箇插入或缺失位點,堿基插入主要髮生在340~419 bp之間的中央區域,以40 bp重複片斷插入的形式進行.每箇箇體含有2~4箇連續重複片斷.對鰳魚進行瞭遺傳多樣性分析,CO Ⅰ基因序列的單倍型多樣性為0.617,覈苷痠多樣性指數為0.001 37,平均覈苷痠差異數為0.950.D-loop序列的單倍型多樣性為0.983,覈苷痠多樣性指數為0.009 98,平均覈苷痠差異數為6.367.綜閤分析,東海區鰳魚的遺傳多樣性併不高,有必要採取綜閤措施對其進行種質資源保護.
이동해구륵어배부기육적선립체DNA작위모판,대16개개체적CO Ⅰ기인화D-loop서렬진행료확증,통과대PCR산물진행쌍향측서,최종득도료691 bp적CO Ⅰ기인편단화718 bp적D-loop서렬편단.용DNASP연건분석득지,16개CO Ⅰ기인서렬정의료6개단배형(재GenBank등록호:HM030765-HM030768,HM030769-HM030770),재6개단배형중,공검측도6개변이위점,기중유5개변이위점발생재제삼밀마자위치상,유1개변이위점발생재제일밀마자위치상.동해구륵어16개개체D-loop서렬공정의료14개단배형(GenBank등록호:HM030781,HM030783-HM030792,HM030794-HM030796).제거삽입/결실위점,14개단배형공검측도30개다태위점,주요발생재D-loop서렬적량단구역;D-loop서렬환검측도80개삽입혹결실위점,감기삽입주요발생재340~419 bp지간적중앙구역,이40 bp중복편단삽입적형식진행.매개개체함유2~4개련속중복편단.대륵어진행료유전다양성분석,CO Ⅰ기인서렬적단배형다양성위0.617,핵감산다양성지수위0.001 37,평균핵감산차이수위0.950.D-loop서렬적단배형다양성위0.983,핵감산다양성지수위0.009 98,평균핵감산차이수위6.367.종합분석,동해구륵어적유전다양성병불고,유필요채취종합조시대기진행충질자원보호.