云南农业大学学报
雲南農業大學學報
운남농업대학학보
JOURNAL OF YUNNAN AGRICULTURAL UNIVERSITY
2013年
1期
61-68
,共8页
哈福%李大林%袁跃云%吴志勇%袁峰%霍金龙%苗永旺
哈福%李大林%袁躍雲%吳誌勇%袁峰%霍金龍%苗永旺
합복%리대림%원약운%오지용%원봉%곽금룡%묘영왕
牛科物种%促卵泡激素β-亚基基因%第1,2外显子%PCR-SSCP
牛科物種%促卵泡激素β-亞基基因%第1,2外顯子%PCR-SSCP
우과물충%촉란포격소β-아기기인%제1,2외현자%PCR-SSCP
促卵泡素(follicle-stimulating hormone,FSH)对刺激动物卵泡发育和促进精子生成具有重要作用,但有关牛科物种FSH基因的群体遗传特征还不十分清楚.本文针对FSHβ基因外显子1和外显子2,采用PCR-SS-CP结合PCR产物直接测序技术对353头水牛(来自11个水牛群体)、30头牦牛和30头大额牛样品进行了群体变异检测,并结合NCBI数据库中已发表的普通牛、山羊和绵羊等物种同源序列进行了群体遗传和生物信息学分析.在FSHβ基因外显子1中,水牛中发现1个核苷酸替换和1个缺失,即c.-49A>G和c.-31delG;其中,SNP-49在河流型和沼泽型水牛中均存在,等位基因c.-49A为优势等位基因,而c.-31 delG只存在于沼泽型水牛中,且为杂合状态,基因频率为0.077.在牦牛外显子1中检测到c.-37G >A和c.-12T>C替换,且为连锁遗传的,而在大额牛外显子1中未检测到SNP位点.在FSHβ基因外显子2中,水牛中发现c.132G>A替换,该位点在河流型和沼泽型水牛均存在,但等位基因频率在两类水牛间不一致.在牦牛外显子2中检测到c.9C>T和c.21C >T替换,该替换也存在于普通牛中;大额牛外显子2为单态,未见SNP位点.生物信息学分析显示,在一些牛科物种FSHβ基因外显子2中发现的SNP位点均为同义替换,揭示了其序列的高度保守性.在牛科物种中,山羊和绵羊FSHβ基因第36位密码子编码氨基酸与其他物种不同,可作为区分它们的遗传标记.
促卵泡素(follicle-stimulating hormone,FSH)對刺激動物卵泡髮育和促進精子生成具有重要作用,但有關牛科物種FSH基因的群體遺傳特徵還不十分清楚.本文針對FSHβ基因外顯子1和外顯子2,採用PCR-SS-CP結閤PCR產物直接測序技術對353頭水牛(來自11箇水牛群體)、30頭牦牛和30頭大額牛樣品進行瞭群體變異檢測,併結閤NCBI數據庫中已髮錶的普通牛、山羊和綿羊等物種同源序列進行瞭群體遺傳和生物信息學分析.在FSHβ基因外顯子1中,水牛中髮現1箇覈苷痠替換和1箇缺失,即c.-49A>G和c.-31delG;其中,SNP-49在河流型和沼澤型水牛中均存在,等位基因c.-49A為優勢等位基因,而c.-31 delG隻存在于沼澤型水牛中,且為雜閤狀態,基因頻率為0.077.在牦牛外顯子1中檢測到c.-37G >A和c.-12T>C替換,且為連鎖遺傳的,而在大額牛外顯子1中未檢測到SNP位點.在FSHβ基因外顯子2中,水牛中髮現c.132G>A替換,該位點在河流型和沼澤型水牛均存在,但等位基因頻率在兩類水牛間不一緻.在牦牛外顯子2中檢測到c.9C>T和c.21C >T替換,該替換也存在于普通牛中;大額牛外顯子2為單態,未見SNP位點.生物信息學分析顯示,在一些牛科物種FSHβ基因外顯子2中髮現的SNP位點均為同義替換,揭示瞭其序列的高度保守性.在牛科物種中,山羊和綿羊FSHβ基因第36位密碼子編碼氨基痠與其他物種不同,可作為區分它們的遺傳標記.
촉란포소(follicle-stimulating hormone,FSH)대자격동물란포발육화촉진정자생성구유중요작용,단유관우과물충FSH기인적군체유전특정환불십분청초.본문침대FSHβ기인외현자1화외현자2,채용PCR-SS-CP결합PCR산물직접측서기술대353두수우(래자11개수우군체)、30두모우화30두대액우양품진행료군체변이검측,병결합NCBI수거고중이발표적보통우、산양화면양등물충동원서렬진행료군체유전화생물신식학분석.재FSHβ기인외현자1중,수우중발현1개핵감산체환화1개결실,즉c.-49A>G화c.-31delG;기중,SNP-49재하류형화소택형수우중균존재,등위기인c.-49A위우세등위기인,이c.-31 delG지존재우소택형수우중,차위잡합상태,기인빈솔위0.077.재모우외현자1중검측도c.-37G >A화c.-12T>C체환,차위련쇄유전적,이재대액우외현자1중미검측도SNP위점.재FSHβ기인외현자2중,수우중발현c.132G>A체환,해위점재하류형화소택형수우균존재,단등위기인빈솔재량류수우간불일치.재모우외현자2중검측도c.9C>T화c.21C >T체환,해체환야존재우보통우중;대액우외현자2위단태,미견SNP위점.생물신식학분석현시,재일사우과물충FSHβ기인외현자2중발현적SNP위점균위동의체환,게시료기서렬적고도보수성.재우과물충중,산양화면양FSHβ기인제36위밀마자편마안기산여기타물충불동,가작위구분타문적유전표기.