中国家禽
中國傢禽
중국가금
CHINA POULTRY
2013年
3期
20-24
,共5页
吴晓平%张红星%吴异健%韩典霖%吴宝成%黄一帆
吳曉平%張紅星%吳異健%韓典霖%吳寶成%黃一帆
오효평%장홍성%오이건%한전림%오보성%황일범
番鸭呼肠孤病毒%σC蛋白%同源性%B细胞表位
番鴨呼腸孤病毒%σC蛋白%同源性%B細胞錶位
번압호장고병독%σC단백%동원성%B세포표위
为预测番鸭呼肠孤病毒(DRV)YB株σC蛋白二级结构和B细胞抗原表位,对DRV YB株的σC蛋白氨基酸序列与参考DRV相应序列以DNAStar软件进行同源性和遗传进化树分析；采用SOPMA法、Gamier-Robson法、Chou-Fasman法和Karplus-Schultz法方法预测其二级结构；用Hopp-Woods法、Emini法、Jameson-Wolf法和吴玉章等建立的方法分别预测蛋白的亲水性、表面可能性和抗原指数,然后综合分析其B细胞抗原表位.结果显示,DRV YB与国内DRV相应序列同源性在93.7％～99.6％,代表性较强；B细胞表位可能在15～27、36～49、40～49及90～98区段或其附近,这4个被预测的表位均含有β-转角和无规卷曲结构.本研究为进一步确定σC蛋白的B细胞表位和反向()计提供了理论基础.
為預測番鴨呼腸孤病毒(DRV)YB株σC蛋白二級結構和B細胞抗原錶位,對DRV YB株的σC蛋白氨基痠序列與參攷DRV相應序列以DNAStar軟件進行同源性和遺傳進化樹分析；採用SOPMA法、Gamier-Robson法、Chou-Fasman法和Karplus-Schultz法方法預測其二級結構；用Hopp-Woods法、Emini法、Jameson-Wolf法和吳玉章等建立的方法分彆預測蛋白的親水性、錶麵可能性和抗原指數,然後綜閤分析其B細胞抗原錶位.結果顯示,DRV YB與國內DRV相應序列同源性在93.7％～99.6％,代錶性較彊；B細胞錶位可能在15～27、36～49、40～49及90～98區段或其附近,這4箇被預測的錶位均含有β-轉角和無規捲麯結構.本研究為進一步確定σC蛋白的B細胞錶位和反嚮()計提供瞭理論基礎.
위예측번압호장고병독(DRV)YB주σC단백이급결구화B세포항원표위,대DRV YB주적σC단백안기산서렬여삼고DRV상응서렬이DNAStar연건진행동원성화유전진화수분석；채용SOPMA법、Gamier-Robson법、Chou-Fasman법화Karplus-Schultz법방법예측기이급결구；용Hopp-Woods법、Emini법、Jameson-Wolf법화오옥장등건립적방법분별예측단백적친수성、표면가능성화항원지수,연후종합분석기B세포항원표위.결과현시,DRV YB여국내DRV상응서렬동원성재93.7％～99.6％,대표성교강；B세포표위가능재15～27、36～49、40～49급90～98구단혹기부근,저4개피예측적표위균함유β-전각화무규권곡결구.본연구위진일보학정σC단백적B세포표위화반향()계제공료이론기출.
