中华实用儿科临床杂志
中華實用兒科臨床雜誌
중화실용인과림상잡지
Journal of Applied Clinical Pediatrics
2013年
2期
127-130
,共4页
张晓群%张盼%杨洋%邱洁%周晓玉%周晓光
張曉群%張盼%楊洋%邱潔%週曉玉%週曉光
장효군%장반%양양%구길%주효옥%주효광
miR-26a%靶基因%生物信息学%肺发育
miR-26a%靶基因%生物信息學%肺髮育
miR-26a%파기인%생물신식학%폐발육
miR-26a%Target gene%Bioinformatics%Lung development
目的 对hsa-miR-26a进行靶基因预测及相关生物信息学分析,为hsa-miR-26a靶基因的实验验证提供数据支持,并为深入研究hsa-miR-26a在肺发育中的生物学功能及调控机制奠定基础和提供理论依据.方法 应用PubMed、Google等信息搜索工具查找miR-26a的所有研究；应用miRBase获取hsa-miR-26a的序列,并分析其序列保守性；利用miRNA靶标基因数据库miRGen2.0进行hsa-miR-26a的靶基因预测,选取PicTar和TargetScanS的交集并合并DIANA LAB-TarBase6.0数据库的已验证靶标对靶基因进行功能富集分析(GO-analy-sis)及信号转导通路分析.结果 已有研究提示hsa-miR-26a在肿瘤、细胞分化、器官发育、免疫系统等生物学过程具有重要作用.hsa-miR-26a在多物种间高度保守.miR-26a调控的靶基因生物学功能主要包括转录调控、蛋白质修饰、细胞增殖、凋亡、分化等基本生物学过程和蛋白激酶活性等分子功能上,靶基因存在于细胞各个组分中,包括细胞膜、细胞质、细胞核中；信号转导通路显著富集于Wnt信号通路,丝裂原活化蛋白激酶信号通路,转化生长因子-β信号通路,p53信号通路,细胞周期、黏附功能等信号通路以及前列腺癌、小细胞肺癌、直肠癌、肾癌、神经胶质瘤5个疾病通路中(P均＜0.05).结论 通过对hsa-miR-26a靶基因的生物信息学分析,为研究hsa-miR-26a在肺发育中的作用提供了功能与机制的线索.
目的 對hsa-miR-26a進行靶基因預測及相關生物信息學分析,為hsa-miR-26a靶基因的實驗驗證提供數據支持,併為深入研究hsa-miR-26a在肺髮育中的生物學功能及調控機製奠定基礎和提供理論依據.方法 應用PubMed、Google等信息搜索工具查找miR-26a的所有研究；應用miRBase穫取hsa-miR-26a的序列,併分析其序列保守性；利用miRNA靶標基因數據庫miRGen2.0進行hsa-miR-26a的靶基因預測,選取PicTar和TargetScanS的交集併閤併DIANA LAB-TarBase6.0數據庫的已驗證靶標對靶基因進行功能富集分析(GO-analy-sis)及信號轉導通路分析.結果 已有研究提示hsa-miR-26a在腫瘤、細胞分化、器官髮育、免疫繫統等生物學過程具有重要作用.hsa-miR-26a在多物種間高度保守.miR-26a調控的靶基因生物學功能主要包括轉錄調控、蛋白質脩飾、細胞增殖、凋亡、分化等基本生物學過程和蛋白激酶活性等分子功能上,靶基因存在于細胞各箇組分中,包括細胞膜、細胞質、細胞覈中；信號轉導通路顯著富集于Wnt信號通路,絲裂原活化蛋白激酶信號通路,轉化生長因子-β信號通路,p53信號通路,細胞週期、黏附功能等信號通路以及前列腺癌、小細胞肺癌、直腸癌、腎癌、神經膠質瘤5箇疾病通路中(P均＜0.05).結論 通過對hsa-miR-26a靶基因的生物信息學分析,為研究hsa-miR-26a在肺髮育中的作用提供瞭功能與機製的線索.
목적 대hsa-miR-26a진행파기인예측급상관생물신식학분석,위hsa-miR-26a파기인적실험험증제공수거지지,병위심입연구hsa-miR-26a재폐발육중적생물학공능급조공궤제전정기출화제공이론의거.방법 응용PubMed、Google등신식수색공구사조miR-26a적소유연구；응용miRBase획취hsa-miR-26a적서렬,병분석기서렬보수성；이용miRNA파표기인수거고miRGen2.0진행hsa-miR-26a적파기인예측,선취PicTar화TargetScanS적교집병합병DIANA LAB-TarBase6.0수거고적이험증파표대파기인진행공능부집분석(GO-analy-sis)급신호전도통로분석.결과 이유연구제시hsa-miR-26a재종류、세포분화、기관발육、면역계통등생물학과정구유중요작용.hsa-miR-26a재다물충간고도보수.miR-26a조공적파기인생물학공능주요포괄전록조공、단백질수식、세포증식、조망、분화등기본생물학과정화단백격매활성등분자공능상,파기인존재우세포각개조분중,포괄세포막、세포질、세포핵중；신호전도통로현저부집우Wnt신호통로,사렬원활화단백격매신호통로,전화생장인자-β신호통로,p53신호통로,세포주기、점부공능등신호통로이급전렬선암、소세포폐암、직장암、신암、신경효질류5개질병통로중(P균＜0.05).결론 통과대hsa-miR-26a파기인적생물신식학분석,위연구hsa-miR-26a재폐발육중적작용제공료공능여궤제적선색.
